由于肛管癌早期有便血、肛门异物感或排便时疼痛，临床上常把早期肛管癌误诊为以上常见的良性疾病，延误诊断、治疗，故在诊断肛管癌过程中应注意与以下疾病的鉴别。

1、肛门窦道：感染形成的肛门窦道有时似肛管癌，但肛门窦道多在前、后正中处，并与齿状线相连，多有一内口位于齿状线处，肛管皮肤完整，麻醉下用探针探查可证实为肛门窦道﹒活检窦道内组织行病理检查为肉芽组织，可以明确诊断。

2、直肠癌：可以侵犯到齿状线及肛管，亦有便血、大便次数增多及肛门下坠不适感，确诊需活检病理检查。

3、肛管黑色素瘤：肿瘤在肛管处少见，典型的黑色素瘤外观似血栓性内痔，触诊为硬性结节，偶有压痛，其表面可形成溃疡或覆着黑色素，但约半数的黑色素瘤因表面无色素而误诊。

参考资料：[1]施宝民,艾开兴.老年普通外科学.第1版[M].上海.上海科学技术出版社.2016.