小儿脑炎是由于病毒或细菌感染引起的颅内感染，少数情况下，真菌感染也会引起小儿脑炎。

1、病毒感染：病毒感染是引起小儿脑炎的常见原因，常见的病毒包括呼吸道的腺病毒、手足口病毒，还有流感病毒、乙脑病毒、单纯疱疹病毒、麻疹病毒等。

此类病毒可以通过不同的途径，如皮肤、呼吸道、消化道，还有黏膜进入血液，引起颅内感染。当出现颅内感染时，小儿可能会出现颅内高压的表现。

2、细菌感染：由于细菌进入脑内引起脑部炎症，或脑膜炎症，还可能是脑膜炎症和脑炎同时存在，称为脑膜脑炎。

婴儿常见的细菌感染引起的疾病就是脑膜炎和脑膜脑炎，如果出现此类脑炎后，通常通过腰椎穿刺脑脊液检查，可以进一步明确诊断。

3、真菌感染：通常真菌不会引起脑炎，只有极少数情况才会引起脑炎，致病菌有球孢子菌、新型隐球菌等。