手足口病在临床上可以分为4期，初期就叫出疹期，第二期叫神经系统受累期，第三期叫心肺功能衰竭前期，第四期叫心肺功能衰竭期，所以第一期出疹期，也就是发病早期的临床表现。手足口病的早期表现是手、足、口的疱疹、发热和疱疹性咽峡炎。

手足口病的潜伏期一般在2-10天，平均是3-5天。病人首发的症状可能表现为低热、全身不舒服、乏力、食欲缺乏，最突出的表现为手、足、口的皮疹。可以看到在手、足底，还有口腔的黏膜上出现皮疹。

首先表现斑疹，在皮肤有充血的红点。随后出现丘疹，最后出现疱疹，而疱疹疱液比较少，一般不疼不痒，不会留有结痂，也不会留有瘢痕。此时病人可能会出现低热，也可能体温会明显增高。

有些病人仅仅出现疱疹性咽峡炎或者低热，疱疹性咽峡炎可能单独存在，临床表现可以不出现手和足的疱疹，病情较重的病人可以表现为疱疹增多，在全身都可能出现疱疹。