肺炎衣原体属于非典型病原体，它是在细胞内细胞样聚集的病原菌。感染机体后是否会自愈，通常与疾病的严重程度有关，病情较轻者有可能自愈。

对于支原体感染病情较轻、表现较平稳的病人，可能会自愈，后期检测支原体抗体时才发现抗体阳性。而对于有明显肺炎表现，如发热、呼吸困难，特别是有基础病的病人、婴幼儿、孕妇，通常不会自愈，应该积极进行治疗。

衣原体感染和支原体感染有类似特点，均有较长潜伏期，大概在数天到1-2周。二者的临床表现也类似，均会有刺激性干咳，部分病人可出现中等程度的发热，其他呼吸道伴随症状可以有咽痛、耳痛、咳嗽等情况，严重的病例还可以有咳脓痰的情况。