肾萎缩通常提示肾脏结构非常差，肾脏的功能可能进展到慢性肾衰竭期，通常是不能治好的，是不能逆转的。

对于肾脏萎缩的患者，需要进行化验检查，比如血常规、生化、尿常规、24小时尿蛋白定量、肾脏彩超，甚至肾动态显像，来评估患者的肾脏功能还残存多少。

对于进展到慢性肾脏病5期，也就是尿毒症5期的患者，可能需要考虑肾脏替代治疗，包括血液透析、腹膜透析、肾移植。

慢性肾脏病的一体化治疗，可能需要进行药物的治疗，包括促红细胞生成素纠正贫血，碳酸氢钠纠正酸中毒。对于高钾、低钙、高龄的患者，还需进行电解质的调节，对于水肿的患者，需要限制饮水、利尿、消肿。