肾盂肾炎的致病菌，常见的有革兰氏阴性杆菌、革兰氏阴性球菌和真菌，不同原因导致的肾盂肾炎治疗方法也不一样。

1、革兰氏阴性杆菌；比如大肠杆菌、变形杆菌，鲍曼不动杆菌等，如果是常见的大肠杆菌感染，可结合药敏结果给予抗生素治疗。

如果是绿脓杆菌的感染，一定要使用敏感的抗生素，因为绿脓杆菌非常难治，容易产生耐药性。

2、革兰氏阴性球菌：比如肠球菌，或者是凝固酶阴性的葡萄球菌，一般可选择敏感的抗生素治疗。

3、真菌：但近年来，随着广谱抗生素的应用，真菌导致的肾盂肾炎的发病率越来越高，尤其是对于免疫力差的老年的男性患者，这种情况很常见。一定要查找患者导致真菌感染的原因，提高患者的抵抗力。具体情况还需咨询肾内科医师。