慢性脓胸治疗为外科治疗难题，其治疗主要是对因治疗，包括抗感染治疗、手术治疗等。

1、抗感染治疗：慢性脓胸需治疗原发疾病，根据不同病因进行不同处理，若为败血症需控制感染；若为肺部感染或肺脓肿需进行相应抗感染或手术治疗消除感染源。

如果患者存在特殊感染，如结核性脓胸或其他特殊病原体感染形成慢性脓胸，还需进行抗结核病、抗其它真菌病或其它特殊细菌感染，针对病因进行特殊抗感染治疗。

2、手术治疗：气管瘘、食管瘘等因素引起的慢性脓胸，需采取相应手段促进瘘口愈合才可达到慢性脓胸治愈目的。慢性脓胸若长期不愈合，感染可持续存在。治疗手段包括通过胸改手术进行脓胸清除、肺切除以及肌瓣转移治疗，但手术风险较大，临床效果不理想。