慢性脓胸手术风险较多，由于慢性脓胸由多种病因导致的临床症候群，需针对慢性脓胸不同病因进行处理，风险主要包括体质下降、感染等。

1、体质下降：如果患者基础体质较差，由于长期慢性脓胸带来体质消耗，患者常存在贫血、营养不良甚至身体机体状况较差的情况；

2、感染：无论慢性脓胸由何种病因引起，最终需进行慢性脓胸的胸改手术或肌瓣填塞等手术，手术创伤较大且手术风险较高，手术效果不理想，可能引起感染，导致慢性脓胸复发。