法洛四联症的常见病因与其他先天性心脏病相同，由基因与环境因素相互作用形成，如胎儿发育环境因素，包括早期宫内感染、孕妇存在大剂量放射线接触史、药物服用史，或孕妇患有代谢紊乱性疾病。如果孕妇在妊娠早期进行酗酒、吸毒，均有可能增加危险，孕妇为高龄产妇也为高危因素之一。

从遗传学角度分析，先天性心脏病具有一定家族发病趋势，可能因父母生殖细胞染色体畸变引起。因此，孕妇孕期拥有良好妊娠环境，杜绝酗酒、抽烟、吸毒等不良习惯，怀孕期间避免有毒有害物质接触，均可减少患病儿出现。