卵巢囊肿不存在最好的治疗办法，医生会根据患者年龄、囊肿的大小、严重程度、伴随症状等方面选择合适的治疗方案，包括生活方式干预、手术治疗等。

1、生活方式干预：卵巢囊肿的患者如果没有自觉症状，超声提示囊肿较小，患者日常生活中保持乐观的心态，充分休息，饮食均衡，不吸烟、不喝酒、不熬夜等都有利于控制囊肿恶化，定期进行超声复查即可，有可能囊肿在几个月内会自行消失；

2、手术治疗：如果卵巢囊肿体积大，直径≥5cm，或观察3-6个月，囊肿持续存在，又或者卵巢囊肿破裂或蒂扭转引起急腹症症状等情况，符合卵巢囊肿手术适应证的情况下，建议进行手术治疗，如卵巢囊肿剥除术 、全子宫切除术或附件切除术等。

除此之外，如果卵巢囊肿比较小的情况下，对于内膜样囊肿可遵医嘱口服短效避孕药进行治疗，对于炎症性囊肿可遵医嘱口服抗生素进行治疗。大多数情况下，经过保守治疗也能使囊肿达到治愈。