如果患者患有痔疮并且合并肛瘘，其治疗方法以手术治疗为主。虽然痔疮可以选择保守用药来缓解症状，但是肛瘘的治疗方法只有手术。

痔疮和肛瘘合并发作时需要通过手术治疗，其术式包括挂线疗法、肛瘘切开术、肛瘘切除术、瘘管切开加挂线疗法等。手术过程当中首先需要将肛瘘的瘘管壁进行切除，在保留肛门局部括约肌功能的前提下，将局部的内痔和外痔结扎切除干净，才使得患者一次手术将所有的肛肠疾病都切除和去掉。

手术之后需做好切口周围局部的清洁卫生，还需要做好伤口的引流和局部的消毒，避免由于引流不畅而引起伤口的感染和假性愈合，必要时遵医嘱静脉滴注抗生素，如注射用头孢唑林钠、盐酸左氧氟沙星注射液等预防感染。