临床并没有卵巢囊肿怎么治疗效果最好的说法，一般需要根据医生建议，针对卵巢囊肿的病因进行治疗，效果较好，常见的治疗方式有调整饮食、调整生活方式、抗感染治疗、调节激素治疗、中药治疗等。

1、调整饮食：饮食不当，摄入胆固醇过多，可能影响卵巢的功能，导致卵巢异常增生，从而出现卵巢囊肿，此时患者需要调整饮食，避免吃富含胆固醇的食物，需要注意保持饮食清淡。

2、调整生活方式：长期接触污染环境，心理压力过大、作息不规律等因素，都可能影响女性的卵巢功能而导致卵巢囊肿，此时患者需要积极调整生活方式，避免熬夜，早睡早起，远离受污染的环境，可以通过散步、旅游、看电影等方式调节情绪。

3、抗感染治疗：如果患者因病原体感染而发生卵巢囊肿，可以遵医嘱使用头孢克洛缓释片、阿莫西林胶囊等药物进行抗感染治疗。

4、调节激素治疗：如果患者存在卵巢内膜样囊肿，可以按照医嘱使用复方炔诺酮片、戊酸雌二醇片雌二醇环丙孕酮片复合包装等药物进行治疗。

5、中药治疗：患者也可以由医生辨证论治后，遵医嘱使用中药配合治疗，如桂枝茯苓胶囊、金刚藤胶囊等。

除上述治疗措施外，如果卵巢囊肿较大，有破裂风险，可以通过卵巢囊肿剥除术、患侧卵巢切除术、附件切除术等方式进行治疗。