小三阳抗病毒治疗的标准按阶段区分，如果小三阳患者处于慢性肝炎的阶段，ALT升高、HBV-DNA阳性，超过2×10^4IU/ml，且除其他原因导致的ALT升高，如药物、酒精、自身免疫等因素，就可以启动抗病毒治疗。

如果处于肝硬化代偿期阶段，无肝硬化并发症、腹水、出血、感染等，HBV-DNA阳性就启动抗病毒治疗。

如果小三阳患者处于肝硬化失代偿期的状态，有腹水、消化道出血、肝性脑病等并发症发生，无论HBV-DNA阳性与否，以及ALT正常与否，只要表面抗原阳性，就启动抗病毒治疗。

如果ALT正常，但年龄超过30岁，有肝硬化家族史或者肝癌的患者。病情进展，通过肝穿刺炎症活动程度大于等于二级，或者纤维化程度大于等于二期，以及通过无创性肝纤维化诊断检查，都是在进展期，也要积极抗病毒治疗。