造血干细胞移植后血小板减低与多种因素有关，常见于造血干细胞移植早期未完全植入、植入不良、感染、移植排异反应、原发病复发等。

1、造血干细胞移植早期未完全植入：由于造血干细胞未能够完全植入，使得血小板生成并未完全恢复，故有血小板低的情况。此时血小板可能并未完全恢复，一段时间后可恢复正常。

2、植入不良：由于造血干细胞植入不良，使得血小板难以正常地产生，故有血小板水平较低的情况。

3、感染：巨细胞病毒感染或其他感染可以引起血小板减少。

4、移植排异反应：移植排异反应引起骨髓造血功能异常，可以出现血小板减少。

5、原发病复发：正常植入造血干细胞被排斥，患者原发病复发可以出现血象减低。