骨髓移植或自身干细胞移植后肺部非感染性并发症发病率高，并且有自己特殊的并发症，主要包括以下两种：

1、移植物抗宿主反应：移植后早期即100天以内多发生在皮肤、肝和胃肠道系统，肺部受累较少见，而迟发型则肺部受累较多见，尤以骨髓移植后多见，可以有多种表现，如闭塞性支气管炎（BO）、闭塞性细支气管炎伴机化性肺炎（BOOP）、慢性支气管炎和迟发型淋巴间质细胞肺炎等；

2、特发性肺炎综合征（IPS）：是移植后出现的弥漫性肺损伤，但同时无感染证据，可以发生在移植后2-6个月，一般在42-49天，发生率12%。临床表现发热、干咳、呼吸困难、低氧血症，影像学示双肺弥漫性浸润影。组织学表现为弥漫性肺泡损伤，间质单核细胞浸润。

参考资料：[1]蔡柏蔷,李龙芸.协和呼吸病学 上下册.第2版[M].北京.中国协和医科大学出版社.2011.