对于腰5骶1的椎间盘变性膨出合并骶管囊肿的治疗，首先需要确定患者的责任病灶，即症状是由椎间盘膨出引起的还是由骶管囊肿引起的。可以通过术前准确的体格检查、病史询问，以及辅助检查，如肌电图和核磁共振等来判断。

如果症状是由椎间盘突出引起的，可以考虑进行相应的椎间盘突出手术。如果症状是由骶管囊肿引起的，可以进行骶管囊肿的手术治疗。如果两者都存在并引起症状，可以同时进行两个手术。

但在临床实践中，骶管囊肿大部分情况下可能没有症状，因此通常无需特殊处理。对于椎间盘膨出或突出的患者，许多患者可以通过保守治疗如药物和理疗等获得改善，并且有很大一部分患者可以恢复正常。在恢复后，患者可以进行长期随访观察。

手术治疗通常在保守治疗无效的情况下考虑，手术治疗可以分为融合性手术和非融合性手术两种方法。对于年轻且初次发作的患者，可以选择非融合性手术，这样可以保持患者脊柱的活动度，并且恢复较快。