先天性巨结肠术后大部分效果均较好，个别可能出现术后并发症，如吻合口感染、吻合口瘘等情况，需要及时寻求医生的帮助。

如果患有先天性巨结肠，需要进行手术治疗，一般会在3-4个月的时候进行手术，此时抵抗力、腹腔条件比较好，所以手术的效果也会比较好。

但是如果没有注意进行护理，就会导致吻合口感染、吻合口瘘，需要及时解决排便问题，在远端吻合口瘘愈合好之后再进行处理，可能需要再次进行手术，如果注意护理并不会出现问题，也不会影响生长发育。

巨结肠手术成功之后，并不代表治疗结束，术后还需进行扩肛治疗和排便训练。