儿童湿疹的病因主要是遗传问题，如果父母是过敏性疾病患者，比如父母一方患有特应性皮炎，儿童患有特应性皮炎的概率达到30%。

如果父母双方患有特应性皮炎，儿童患有特应性皮炎的概率会高达70%-80%。根本病因，即湿疹儿童的皮肤、表皮，编码蛋白基因有缺失，基因缺陷导致皮肤屏障功能下降，出现皮肤皮疹的情况。

通过食物摄入到体内的过敏原可以引起湿疹，皮肤经过接触也可以直接引起皮肤湿疹表现。皮肤湿疹主要是自身DNA、父母双方遗传、接触过敏原等综合因素，才导致儿童出现湿疹表现。

如果儿童生活在层流室里面，生活在不接触任何过敏原的真空罩里面，则DNA缺陷，甚至有遗传的湿疹也不会发作。