角膜基质层的营养不良包括颗粒状营养不良、斑块状营养不良、格子状营养不良，具体如下：

1、颗粒状营养不良：TGF-β基因突变引起，常染色体显性遗传。在角膜中央前层基质有界限分明的灰白色颗粒状混浊，混浊点之间的角膜保持透明。病理学上为嗜酸性的玻璃样物质以丛状沉积于基质，用Masson胶原染色表现为鲜红色；

2、斑块状营养不良：为常染色体隐性遗传，组织学特点是角膜浅层基质中出现不规则、边界不清的灰白色斑点状混浊，病灶间角膜实质层亦模糊。逐渐累及整个角膜，直达角膜缘。病变晚期角膜全层混浊。病理学表现为最初黏多糖在角膜基质层空隙内、角膜上皮细胞和内皮细胞内随机性沉积，角膜上皮层欠平整、前弹性层断裂，内皮细胞坏死。病灶的特征性染色为Alcian和胶质铁染色后呈醒目的蓝色；

3、格子状营养不良：常染色体显性遗传病，累及中央部角膜，呈现为格子状、条状或网状混浊。以后发生复发性上皮糜烂。组织病理学表现为上皮下至浅层基质内有大量淀粉样物质沉积，呈均质团块状、纺锤状或条状，刚果红染色阳性。

参考资料：[1]刘祖国.眼科学基础.第3版[M].北京.人民卫生出版社.2018.