怀孕1个月自然流产，50%-60%与胚胎染色体异常有关，自然流产的病因主要有胚胎因素、母体因素、父亲因素和环境因素，胚胎染色体异常是早期流产最常见的原因，约占50%-60%。

染色体异常的包括数目异常和结构异常，数目异常以三体最多见，常见的有13三体、16三体、18三体、21三体和22三体。其次为X单体、三倍体及四倍体，比较少见。

有条件的话，流产后可以行绒毛膜染色体核型分析，对明确流产的原因有帮助。早期的流产胚胎多在排出之前已经死亡，常会伴有底蜕膜的出血、周边组织的坏死、胚胎绒毛的分离，已经分离的胚胎组织如同异物，可以引起子宫的收缩，妊娠物多能自行完全排出。