诊断急性病毒性心肌炎病原学依据是通过实验室检查，检测出相关病毒成分、病毒抗体以及病毒特异性IgM。

1、病毒成分：急性期从心内膜、心肌、心包或心包穿刺液中检测出病毒、病毒基因片段或病毒蛋白抗原。

2、病毒抗体：第二份血清中同型病毒抗体效价较第一份血清升高4倍(2份血清应相隔2周以上)或一次抗体效价≥1：640者为阳性，1：320者为可疑阳性(如以1：32为基础者则宜以≥1：256为阳性，1：128为可疑阳性，根据不同实验室标准做决定)。

3、病毒特异性IgM：以≥1：320者为阳性(按各实验室诊断标准，需在严格质控条件下)。如同时有血中肠道病毒核酸阳性者更支持有近期病毒感染。

参考资料：[1]于学忠,周荣斌.中华医学百科全书 临床医学 急诊医学[J].北京:中国协和医科大学出版社,2018.1.