卵巢囊肿5厘米是否严重，主要与囊肿性质，以及并发症有关。

1、囊肿性质：若为良性卵巢囊肿为5厘米，并不算严重的疾病，多可自行吸收，如炎症刺激引起的卵巢囊肿，炎症治疗好转后囊肿也会逐渐自行吸收。怀孕后，体内激素刺激卵巢黄素囊肿，随着怀孕激素水平的稳定，则可自行吸收。

但若为恶性卵巢囊肿，属于较为严重的情况，通常需及时手术治疗。

2、并发症：若卵巢囊肿5厘米，但并无并发症，多不严重。但若卵巢囊肿属于巧克力囊肿，属于子宫内膜异位症，可能引起女性出现不孕、痛经等情况。另外，若卵巢囊肿的患者出现急腹症，可能危及生命。这时病情非常严重，需尽快进行手术治疗。