再生障碍性贫血的病人肺部感染时，要确定肺部感染是细菌感染、病毒感染还是真菌感染，根据不同的病原菌选择不同的治疗方法和药物。

再生障碍性贫血由于造血功能衰竭，外周血细胞减少，中性粒细胞减少，使得再生障碍性贫血容易并发肺部感染。肺部也是再生障碍性贫血感染时最常见的部位之一。并且一旦再生障碍性贫血，合并肺部感染一般比较严重，不容易控制。

目前可以选择的广谱抗生素、强力抗生素有很多，通过查找导致肺部感染的病原菌进行药敏试验，针对性应用抗生素。强力、有效的抗生素能够控制再生障碍性贫血并发的肺部感染，建议尽量挑选一些对骨髓抑制小的抗生素。

如果是真菌感染，还需要进行抗真菌治疗，时间相对要长。