中医认为溃疡性结肠炎属于痢疾、泄泻、肠风、下利，在治疗方面提倡辨证治疗。

肠道湿热症症状有腹痛、腹泻、脓血、大便次数多、口干、口苦或发热、舌质红、苔黄腻、脉滑数，治疗采取清肠化湿，处方有芍药汤，常用的药物有黄连、黄芩、白芍、木香、甘草。

一般可临证加减，如大便带血加地榆、鹤草、槐花，如果入络血出血不止，可加水牛角片、赤芍、丹皮、生地、黑山栀子，湿浊重、舌苔油腻可加石菖蒲、生薏米、败酱草。

虚弱症主要症状包括腹痛、大便稀疏、食欲不振、腹痛、腹泻、疲劳、舌质轻、体胖、牙痕、苔藓薄白、脉络虚弱，还有肝肾阴虚症主要症状有大便干燥、黏液、脓血、瘦身、口干或低热、舌红无苔裂纹、脉细数等。

治疗可采取滋肾养肝，处方有六味地黄丸，常用药物有干地黄、山茱萸、山药、茯苓、丹皮、枸杞、白芍。

如果阴虚络涩不畅，腹痛或腹部包块可加当归、桃仁、赤芍、莪术，阴虚血热时可加药丸、侧柏叶、地榆、鹤草，排便不畅可加决明子、何首乌、当归。