腓骨骨折3年了还没长好，要考虑骨不连的可能性大。对于骨不连，主要根据其类型不同来决定治疗方案，骨不连主要有肥大型和萎缩型两种。

1、肥大型：如果是血供丰富型的骨不连，即肥大型骨不连，可通过将移位的骨折端进行再次复位，骨折端的加压以及坚强的内固定来获得愈合。

2、萎缩型：对于萎缩型骨不连，即缺血性骨不连，需要通过切除硬化骨、打通髓腔，进行坚强的内固定，大量植骨或通过肢体的延长，恢复骨原来的长度，才能获得愈合。

腓骨部位一般是由于固定不牢固造成的，因为如果是腓骨下段的骨不连主要是局部的应力所致，一般建议更换内固定，切除瘢痕组织，局部植骨来达到愈合目的。

同时术后可予以物理治疗，如电磁疗、热疗、超声波等治疗，也可予以中医方面的穴位治疗、芒针治疗等。