卵圆孔未闭可能会导致偏头痛，主要与静脉血混入动脉血或血栓形成等因素有关，需要针对原因进行治疗。

1、静脉血混入动脉血：左心房与右心房相通，可能导致动脉血中混有静脉血，并进入大脑血液循环，无法给大脑组织，供给足够的营养物质，可能引起大脑供氧不足，从而导致患者出现头痛。

2、血栓形成：如果出现卵圆孔未闭合，静脉血中有栓子形成，栓子可能通过血液循环，进入大脑循环系统中，堵塞大脑小血管引起头疼。

3、血压升高：可能引起颅内血管扩张，血管内压力升高，可能引起头疼。

4、其他因素：患者同时存在颈椎骨质增生、颈椎退行性改变等病变，压迫椎基底动脉以及颈神经，可能引起头疼。