湖南医药学院总医院神经外科是市州级省临床重点专科，2017年，医院积极推进多学科合作，建成国家高级卒中中心、湖南省卒中中心，设立脑卒中绿色通道，牵头成立了怀化市脑卒中救治联盟。神经外科现有医护人员93名，其中医生24名，主任医师5名，副主任医师4名，主治医师8名，硕士生导师1名，其中博士学历1名，硕士学历16名，技术力量雄厚。神经外科设置两个病区，神外一科和神外二科，每个病区都配备有自己的8张床位重症监护室，两科共有编制床位114张。

业务覆盖颅脑损伤、颅脑肿瘤、椎管肿瘤、脑血管疾病、功能神经外科、神经重症等。对中枢神经系统各部位的复杂难治性肿瘤、脑血管疾病、癫痫、三叉神经痛等疾病的治疗具有丰富的经验。开展神经介入治疗脑血管病、三叉神经微血管减压治疗、颈内动脉内膜剥脱治疗、内镜下颅内及脑室血肿清除、内镜下肿瘤切除等多项特色治疗技术。其中脑动脉瘤、鞍区、桥小脑角及四脑室等深部肿瘤的手术治疗达到省内先进水平。