上海交通大学医学院附属新华医院新生儿科，由我国儿科著名老前辈冯树模和吴圣楣等教授在1970年代初创建并不断发展，2008年正式成为独立科室。目前为教育部“211工程”重点学科，博士培养单位，上海市危重新生儿会诊抢救中心。

多年来是中华医学会儿科学会新生儿学组和中华医学会全国围产学会等学术组织的成员单位。学科带头人朱建幸教授目前担任中华医学会全国围产学会、上海医学会围产学会副主任委员，中华儿科学会新生儿组委员，《中华围产医学杂志》《中国新生儿科杂志》副总编和《中国循证儿科杂志》和《临床儿科杂志》副主编等。

新生儿科现拥有核定床位数64张，年出入院人数2000余人次。医护人员98人，具有高级职称10人，博士学位12人，其中6人任职于国家级学术团体，6人任职于省市级学术团体，博士生导师2人，硕士生导师4人。有5名医师具有在北美、欧洲等发达国家医院和研究机构一年以上的学习培训经历。

目前形成了以危重新生儿呼吸支持，营养支持技术，危重新生儿整体监护（包括围手术期生命支持）、新生儿脑损伤防治，新生儿脑发育评估和干预，新生儿遗传代谢疾病及出生缺陷的诊治为专业特色的学科。在上海市儿科医学研究所设有围产研究室。新生儿专业完成过国家七五、八五攻关项目。

近年来共承担23项课题，其中国家级7项，发表150余篇论文，其中SCI收录期刊28篇，EI收录期刊2篇，获国家发明专利2项。出版教科书和专著10余部。所在单位上海交通大学医学院附属新华医院是上海交通大学医学院儿科系所在单位，也是《临床儿科杂志》所在单位。儿科学教学2009年评为国家精品课程。

新生儿科是国内率先开设新生儿重症监护室和使用呼吸机技术的单位之一。具有应用国内外最先进诊治技术的经验和能力，拥有各种高级多功能常频和高频呼吸器，一氧化氮吸入治疗仪、高级辐射暖床和暖箱、床旁血气监测仪、24小时脑电监测仪，床旁头颅B超机和CRRT等设备，收治新生儿和服务范围辐射上海市各个区县和长三角地区，在全国拥有重要的地位和影响作用。