上海交通大学医学院附属新华医院耳鼻喉头颈外科，于1958年建立，由我国著名耳鼻咽喉科专家毛承樾教授创建。在历任主任和学科带头人带领下，历经半个多世纪的发展，在医疗、教学和科研方面取得了令人瞩目的成绩。
上海交通大学医学院附属新华医院耳鼻喉头颈外科在专业领域综合实力全国排名稳居前十位，是“卫生部国家临床重点专科”、上海市“重中之重”临床重点学科、中国残联及上海市人工耳蜗植入定点单位、上海市耳鼻咽喉质控中心、上海市儿童听力障碍诊治中心、上海市住院医师及专科医师培训基地。
耳鼻喉头颈外科拥有医师21人，其中高级职称12人，博士学位12人，硕士学位4人，博士生导师3人，硕士生导师1人。学科下设耳神经及颅底外科、头颈肿瘤及咽喉外科、小儿耳鼻咽喉科、鼻外科等三级学科，开放床位85张，年手术量达5000台，年门诊量逾20万人次。
近年来耳鼻喉头颈外科在保持传统业务范围的基础上，瞄准学科发展前沿，积极开拓新的领域，确立了以耳显微耳神经侧颅底外科、人工耳蜗植入、头颈肿瘤外科、小儿耳鼻咽喉科、内窥镜微创外科及为重点，带动耳鼻咽喉科其它亚专业共同发展的格局。
耳鼻喉头颈外科多次举办国际会议，如2010年听力国际会议、2014第四届东亚耳科论坛、2015第七届国际听神经瘤会议，并成功申办第八届梅尼埃病及内耳疾病国际论坛，将于2020年4月15-18日在上海召开。多次举办颞骨颅底解剖训练班、新华耳科论坛、全国听力学习班、小儿耳鼻咽喉头颈外科学习班、鼻科论坛、上海眩晕论坛，与国内外专家学者和同道共同交流、探讨学科最新发展动态，推动了这些领域的进步和发展。
听力障碍眩晕诊治中心
1、系统而全面的听力检查，开展目前国内最全面、最先进的各项听力学评估检测方法。
2、系统而全面的前庭功能检查，开展目前国内最完备和最先进的前庭及平衡障碍相关检测项目。
3、接受各医疗机构听力筛查未通过的转诊婴幼儿，进行早期诊断、早期干预。
4、根据听力状况，为先天性耳聋、人工耳蜗植入前的儿童，以及各种原因导致的听力下降的成人验配及调试助听器。
5、人工听觉植入前评估和植入术后调机，开展适合不同类型听力损失的人工听觉植入项目。
6、开展耳聋基因诊断与遗传咨询门诊，近年来为逾2000例先天性耳聋患者及其家属提供了耳聋基因诊断、产前诊断及婚育指导。
7、良性阵发性位置性眩晕（BPPV）的诊断和复位，开展BPPV的临床诊断及手法复位治疗。
耳鼻咽喉内镜中心
1、系统全面的耳、鼻、咽、喉、支气管内窥镜检查及诊断。
2、频闪喉镜检查，评估嗓音疾病。利用频闪光源，观察声带运动状况的检查手段，了解声带黏膜上的微细病变，具有无创、无损伤、低痛苦的优点。
3、内镜下治疗，包括内镜下耵聍冲洗，内镜下鼓膜穿刺抽液、鼓室内注射激素治疗突发性耳聋、梅尼埃病等内耳疾病，鼻科及耳科手术术后清理等。
4、内镜门诊手术，内镜下微创声带息肉摘除术，内镜下鼻出血诊治，包括内镜下前、后鼻孔填塞，鼻内镜下双极电凝止血术，内镜下鼻咽及咽喉部肿物活检术等。
5、内镜下异物取出，包括儿童及成人常见的咽喉部异物、外耳道异物、鼻腔异物取出等治疗。
小儿耳鼻咽喉科
1、儿童阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合症的手术治疗，对儿童OSAS（阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合症）采用多种诊治手段，包括内镜检查及多导睡眠监测检查、内镜下微创手术、扁桃体低温等离子射频消融等。
2、婴幼儿喉气管疾病诊断与治疗，已建立从急救诊治、重症监护，到外科手术治疗及围手术期康复的救治体系，规范处理包括新生儿及婴幼儿的上气道疾病、喉气管疾病等复杂的疑难病例及危急重症，开展声门上成形术、疤痕狭窄切除球囊扩张、“T”管支架植入及肋软骨移植气管成形术等。
3、婴幼儿儿童咽喉头颈部脉管瘤治疗，对婴幼儿咽喉、头颈部及气管内淋巴管瘤，血管瘤等脉管畸形疾病采取个体化治疗方案
4、儿童侧颅底肿瘤个体化治疗，对儿童先天性颞骨胆脂瘤、畸胎瘤、横纹肌肉瘤、神经母细胞瘤、朗格汉斯细胞增生症、后组颅神经鞘膜瘤等疾病的诊断与处理有丰富的经验。
耳神经及侧颅底外
1、顽固性眩晕的外科治疗，对保守治疗无效的梅尼埃病采用内淋巴囊减压、内淋巴囊阻断、半规管阻塞、不同径路的前庭神经切断、迷路切除等外科治疗方法，有效控制眩晕、阻止听力下降、改善耳鸣。
2、侧颅底肿瘤手术，采用不同的手术径路和方法如颞下窝径路、颞骨切除等，达到切除肿瘤、保留神经功能的效果，对各种颞骨良、恶性肿瘤进行保留神经功能的根治性手术并一期修复。
3、人工听觉植入手术，对不同类型的耳聋患者进行人工耳蜗、振动声桥、骨锚式助听器植入或骨桥植入，配合言语康复训练，使患者的听觉言语功能得以康复。
4、慢性中耳炎的鼓室成形术，对各种慢性中耳炎，在清除病灶的同时，重建听骨链并修补鼓膜，使听觉功能得以恢复。
5、面神经疾病的外科治疗，针对不同病因引起的面神经麻痹、面肌痉挛以及面神经肿瘤等采用面神经减压、吻合、移植等手术，以恢复面神经功能。
6、咽鼓管球囊扩张成形术，对保守治疗无效的症状性咽鼓管功能障碍、慢性分泌性中耳炎、伴咽鼓管功能障碍的慢性化脓性中耳炎采用咽鼓管球囊扩张成形术治疗，改善咽鼓管功能。
咽喉及头颈外科
1、喉癌、下咽癌、颈段食管癌的临床多学科综合治疗，开展早期喉癌低温等离子射频微创切除术，各种保留发音的喉部分切除术，对下咽癌、颈段食管癌进行胃代食管、胸大肌皮瓣修复的手术治疗，并在术前或术后进行放疗或化疗等，以达到最佳治疗效果。
2、神经监护下的甲状腺及腮腺手术，应用精细解剖技术开展各种甲状腺及腮腺手术。③成人阻塞性睡眠呼吸暂停综合症（OSAHS）综合诊疗，对成人OSAHS采用多种诊断和治疗手段，包括鼻内镜及咽喉镜、睡眠监测（PSG）等综合评估病情，合理地选择治疗措施，包括呼吸机验配及调试，内镜下微创手术、低温等离子射频消融等，强调治疗规范化和个体化综合治疗。
3、颌下腺移位防治鼻咽癌放疗后口干燥征，鼻咽癌患者放疗前采用颌下腺移位术，有效保留颌下腺分泌功能，缓解放疗后口干症状。
鼻科
1、鼻内镜外科，微创治疗各类鼻窦炎，鼻息肉，鼻中隔偏曲，鼻出血，鼻囊肿，鼻腔鼻窦良、恶性肿瘤，鼻咽纤维血管瘤等鼻科疾病，治疗效果良好。
2、鼻颅底微创手术，运用鼻内镜外科技术进行经鼻脑脊液鼻漏修补术、脑膜脑膨出修补鼻术、鼻咽纤维血管瘤切除术、经鼻眶鼻窦及前、中颅底异物取出术；对垂体肿瘤及眼眶球后视神经肿瘤等颅底疾病进行微创摘除，避免开颅，减少并发症，手术成功率高。
3、鼻眼相关疾病的诊治，在鼻内镜下进行鼻腔泪囊吻合治疗慢性泪囊炎，效果良好。同时开展视神经管减压，眶减压等其他复杂鼻眼相关疾病的诊治。
4、过敏原检测，过敏性疾病有其多样化的过敏症状，过敏原皮肤点刺筛查可以识别出真正的过敏性鼻炎患者，保证脱敏治疗合理、有效使用。
鼾病诊治中心
1、鼾病诊断，对鼾病患者开展多导睡眠监测及鼾症内镜检查。
2、阻塞性睡眠呼吸暂停综合症治疗，开展呼吸机验配及调试工作。