沈阳医学院附属二院感染科，正式开诊于2015年10月，门诊包括呼吸道发热门诊、肠道门诊，出对发热肠道疾病患者处理以外，还对传染病患者予以甄别，如发现国家法定传染病患者立刻转入传染病院治疗。
病房主体涵盖除法定传染病之外的各个系统感染性疾病的诊疗，如呼吸道感染、血液系统感染、泌尿系统感染、胃肠道腹腔感染及皮肤感染，此外还收治不明原因发热的患者；科室还负责疑难感染病会诊、医院感染控制、抗菌药物应用管理及细菌真菌感染诊疗继续医学教育等内容。
感染科设有28张床位，医务人员共15人，均经过严格、系统、全面业务培训。医生6名，其中3名获得呼吸、感染专业硕士学位，感染科全体医务人员以饱满的工作热情，患者治病第一的宗旨为广大患者服务。
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