上海市公共卫生临床中心妇产科，是全国最早的肝病妇产科临床专科，还是国家教育部重点学科、复旦大学妇产科学的重要组成单位、上海市卫健委重点学科、上海市五家危重孕产妇抢救会诊中心之一（传染病为主）、上海市产科肝病监护中心。妇产科在疑难、危重孕妇肝病救治方面积累了丰富的经验，并辐射周边地区。

妇科方面，在全面开展妇科基础医疗技术外，重点发展特色技术，目前主要开展以微创技术为主导的妇科技术，科室配备腹腔镜、宫腔镜、阴道镜、LEEP刀、激光治疗仪等进口先进性能的检查、治疗设备，可进行宫颈疾病诊疗、宫腔镜检查与手术、腹腔镜微创手术、阴式微创手术、盆底功能障碍手术、恶性肿瘤手术、恶性肿瘤的化疗等，将国内外一系列先进、有效的诊治方法广泛应用于临床。

产科在感染性疾病的母婴传播阻断方面独具特色，紧跟国际学术前沿，结合孕妇的实际情况，个体化进行母婴阻断指导，并对新生儿进行及时、细致的处理及规范的随访检查措施，母婴阻断成效显著，2019年至今乙肝母婴阻断成功率100%，HIV母婴传播阻断成功率多年保持100%。