哈尔滨市中医医院针灸科伴随建院成立至今已有62年历史，逐步形成了医、教、研三位一体独具特色的科室，在疾病防治方面独具特色，在省市内外享有较高声誉。目前科室有医务人员五人，主任医师一人，副主任医师一人，主治医师二人，住院医师一人。

针灸作为一种独特的治疗手段，临床涉及内、外、妇、儿、五官等多种病症。科室临床以门诊为主。

特色治疗有：传统的毫针刺法，耳穴疗法，艾灸，电针，温针，火针，穴位贴敷，穴位埋线，刺络放血疗法，红外线治疗仪等。

近年来科室已形成数个治疗优势病种：周围性面瘫、中风后遗症、颈腰椎病、神经性头痛、便秘、月经不调、痛经、失眠、焦虑、眩晕、单纯性肥胖、带状疱疹等。在治疗呃逆、前列腺增生症、老年性压力性尿失禁、小儿遗尿症、亚健康状态、视疲劳综合征、黄褐斑等针灸疗法也具有极好的疗效和优势。