南方医科大学南方医院肾内科，于1989年组建，在两代学科带头人张训教授、侯凡凡教授的领导和建设下，学科发展迅速，1990年成为硕士学位授权点，1995年成为中国人民解放军肾脏病中心、广东省“五个一工程”重点专科，1996年成为博士学位授权点和国家临床药理基地科室。
2000年被批准为中国人民解放军肾脏病研究所、临床医学博士后流动站主要学科，2001年成为解放军肾功能衰竭重点实验室、广东省肾脏病重点实验室，2013年成为器官衰竭防治国家重点实验室和慢性肾病国家临床医学研究中心。
肾内科由专科病房、血液净化中心和肾脏病实验室三部分组成，专科病房拥有床位100张；血液净化中心拥有血透机、血浆置换机及连续性肾替代治疗仪等60余台；
肾脏病实验室由“肾脏病理学”、“肾脏免疫学”、“分子生物学”、“细胞生物学”和“生物化学”等七个功能实验室，能完成从核酸到蛋白质水平的基础研究，实验室实行对外开放，2000年以来已培养博士后、博士和硕士研究生60名，培养国外学者（进修1年以上）5名。
肾内科带头人侯凡凡教授，中国科学院院士，南方医科大学肾脏病研究所所长，肾内科主任，博士生导师，承担国家自然科学基金重点项目等国家级和省部级重点项目14项，获国家科技进步二等奖2项，省部级一等奖4项等，获总后勤部“科技金星”称号和第七届“丁颖科技奖”。
近年来，学科在急慢性肾功能衰竭的发病机理及并发症的防治以及肾脏替代治疗等方面取得了长足的进展，形成了自己鲜明的专科特色，开发、推广了一系列新业务新技术。
一、临床循证医学研究成果丰硕
1、用循证医学研究证据，为延缓慢性肾脏病进展的临床实践提供了新策略。我国进入尿毒症的慢性肾脏病人数以每年11％的速度递增，而目前有条件接受透析和肾移植的患者尚不到尿毒症人群的5％。血管紧张素转换酶抑制剂（ACEI）等肾素、血管紧张素系统抑制剂是目前证据较多的能够保护肾脏、延缓慢性肾脏病进展的药物，但对晚期慢性肾脏病患者，多数医生因顾虑疗效和安全性而放弃上述药物治疗，致使目前80％晚期慢性肾脏病患者未能接受有效治疗。
侯凡凡教授和她的团队通过目前认证度很高的随机、双盲、安慰剂对照的循证医学（RCT）研究，证实ACEI能有效延缓晚期非糖尿病慢性肾脏病的进展，使其发展至尿毒症的危险性降低43％。在有效监控下，晚期慢性肾脏病患者服用ACEI的不良事件率与服安慰剂相仿，从而突破了肾素、血管紧张素系统抑制剂不能用于晚期慢性肾脏病的传统治疗禁区，使更多患者慢性肾脏病进展得到延缓。
成果于2006年1月发表在医学类影响因子很高的国外期刊NEnglJMed(IF44.016)。该杂志配发社论，称“是改变我们对慢性肾脏病治疗策略的时候了”。论文发表后10个月，被25个省、自治区的49家医院推广应用。
被国家教育部评为“2006年度中国高等学校十大科技进展”。此外，她和她的团队还通过循证医学研究，首次证实采用“个体化滴定”的方法逐步增加ACEI或ARB剂量能很大限度地减少慢性肾脏病的蛋白尿，“抗蛋白尿剂量”的肾素、血管紧张素系统抑制剂延缓慢性肾脏病进展的作用明显优于目前临床实践采用的常规剂量。该项研究不仅为肾脏保护提供了新方法，同时用循证医学证据证实，控制蛋白尿应作为慢性肾脏病治疗的重要目标。
2、通过循证医学研究证实，早期使用促红素纠正肾性贫血明显降低CKD左心室肥厚的发生率，并使近20％CKD患者已存在的左心室肥厚逆转，为防治CKD的左心室肥厚提供了循证医学依据。
3、通过对580例患者的临床分析，证实PTCA加支架介入治疗能明显降低CKD患者的冠状动脉再狭窄率，提高5年生存率。
4、由南方医科大学南方医院肾内科组织，项目参与单位协作，在国家疾病控制中心慢性病防治中心的协助下，采用抽点调查的方式，对收治病源覆盖我国东、西、南、北、中部6个地区的12家三级甲等医院2002年12月~2003年12月间收治的所有CKD患者进行流行病学调查，建立了国内有代表性的资料库；揭示了我国CKD患者CVD的发病特点和危险因素；为针对我国CKD患者的特点防治CVD提供了依据。
二、对慢性肾衰及透析并发症的发病机制与临床防治提出了新观点
慢性肾衰（CRF）和透析远期并发症是慢性肾衰病人致死、致残的主要原因，国家为此每年支付的医药费用高达38.0亿元。由于其发病机制尚未阐明，故缺乏有效防治方法。南方医科大学南方医院肾内科经过多年潜心钻研，取得了多项成果，在全国推广后取得了良好社会效益。在南方医科大学南方医院肾内科血液净化中心接受治疗的慢性肾衰血透患者10年存活率达35％。
1、阐明β2M淀粉样蛋白选择沉积于骨关节组织的机制，提出原位修饰学说并得到国际承认；发现、克隆了人关节滑膜细胞AGE受体并证实其介导DRA的组织病变；根据国人数据建立了DRA无创诊断方法并证实其早期诊断价值；首次证实肼类化合物阻断β2M的AGE修饰，为防治DRA提供了药物干预靶点。
2、通过研究尿毒症患者免疫缺陷和感染并发症：揭示了CRF单核、淋巴、NK、红细胞免疫缺陷的机制，首次证实调理素-调理素受体缺陷是CRF单核细胞功能障碍的主要原因，为CRF并发的结核提供了早期诊断方法，制定了预防治疗指征，使结核发生率由4.7%降至0.76%；
首次调查了国人CRF金葡菌携带率及其与透析病人菌血症的关系，对慢性携菌者预防治疗使金葡菌菌血症发生率降低67%；根据肝组织炎症和纤维化半定量评价，制定了肝炎标志物阳性肾移植受者术前筛选标准，使术后肝功障碍发生率由23%降至3.2%。
三、在急性肾衰发生机制及临床防治方面积累了丰富经验。
对APACHEⅡ积分大于29的复杂性急性肾衰的抢救成功率达25%；曾7次派出医疗组参加中央、省市组织的重大抢救，被中央保健局誉为“有胆有识”。
四、成功研制治疗慢性肾衰竭新药—尿毒清，获国家新药研制三等奖，并获国家新药证书，已在全国范围内广泛应用于慢性肾衰竭早期患者的治疗。
以上研究成果先后获国家科技进步二等奖、省部级科技进步一、二等奖等共14项，获国家发明专利2项。