广东省妇幼保健院新生儿外科，是广东省成立最早、规模最大的新生儿外科专科之一，是广东省新生儿畸形救治中心，广东省小儿外科学会新生儿外科组长单位、青年委员会副主委单位，中国出生缺陷干预救助基金会先天性结构畸形救助项目广东省项目管理机构及定点医疗机构。主要收治患有先天畸形及后天性外科疾病的新生儿，接收全省各地及周边省份基层医院转运的危重先天畸形患儿，核定床位有43张，年收治病人数达1600余例，年手术量1200余台。拥有一批先进的胸腔镜、腹腔镜、ICU护理抢救设备。以胎儿先天畸形的产前评估咨询、生后早期诊治的一体化服务，先天畸形腔镜微创治疗及术后早期喂养、快速康复等为特色，在各种重大先天畸形的胸腹腔镜手术及早产儿、低体重儿的手术治疗等方面达到全省乃至全国先进水平。

广东省妇幼保健院新生儿外科拥有一批高学历、经验丰富的医疗护理队伍，其中主任医师3名，副主任医师1名，硕士生导师2名；博士1名，研究生学历11名；广东省杰出青年医学人才1名。是临床、科研、教学并举的广东省龙头单位，与广东省内及周边省份100余家各级人民医院、妇幼保健院建立紧密转诊、技术指导、专科联盟、医联体等不同形式的合作关系，年转运人次达500例以上，为基层医院解决了先天畸形及危重外科患儿的手术相关问题，为降低全省围产儿死亡率、提高全省出生缺陷儿的救治率并改善其预后作出了重要贡献。