广州市番禺中心医院感染科为番禺区政府制定唯一收治传染性疾病的科室。承担番禺区全部普通传染性疾病及突发性传染性疾病的收治任务，及番禺区传染性疾病防治科知识培训基地。从03年“非典”、04年“禽流感”、05年“流脑”、06年“登革热”、09年“甲流”及14年“登革热、埃博拉出血热”至等每一次疫情发生，我科均能按上级指示顺利完成收治及宣传教育防疫任务，受到上级政府领导表扬及奖励，同时积累了丰富的收治经验。先后被评为“省市抗击非典先进集体”、“多人荣誉省政府抗击非典二三等功”。

感染性疾病科从1990年开始从区人民医院内科独立成立传染病科的二级临床科室，设有床位39张，病房均为单人及双人独立病房，病房有独立卫生间、电热水器、电视，生活设施齐全。还同时设有发热门诊、肠道门诊、肝炎肝病专科门诊等。

全科共有医护人员29人，编制医师13人，其中主任医师3人，主治医师4人，副主任护师1人，主管护师2人，博士研究生1人，硕士研究生3人。学科主任为黄明寿主任医师。

感染科主要收治感染性疾病：如肝炎肝病、结核性疾病、结核咯血、结核性脑膜脑炎、发热查因、腹泻查因等感染性疾病，特别是对病毒性肝炎、重型肝炎，另外对肝硬化、脂肪肝、酒精性肝病的治疗也具有较高诊治水平。在肝炎及肺结核的诊治能达到省级医院的诊治水平。