重庆医科大学附属第一医院医学检验科1957年由原上海第一医学院（现复旦大学）附属医院分迁来渝创建，是国家级重点学科“临床检验诊断学”的重要组成部分，是首批国家临床重点专科建设项目单位。本专科拥有5个中心，2个基地：重庆市医学检验科医疗质量控制中心、重庆市细菌耐药监测网中心、重庆市真菌病监测中心、重庆市转化医学中心、重庆市临床检验装备应用评价中心；是国家临床检验住院医师规范化培训基地、全国细菌耐药监测实践培训基地，于2008年通过ISO15189认可，2016年通过美国CAP认证。
学科亚专业设置齐全，拥有国际一流的检测仪器和设备，开展项目和年标本检测量在重庆市位列前三。近年来学科在医疗、教学及科研工作中实现了跨越式发展，影响力不断提升，2016年、2017年和2018年连续三年进入复旦专科排名提名。
科室是临床学院的实验诊断学教研室，设置有急诊检验、临床血液、临床体液、临床生化、临床免疫、临床微生物、临床分子生物学、前处理8个亚专业组，开展项目474项，定量项目室内质控全覆盖，其中临床微生物学、临床分子生物学及临床化学为特色亚专业。开展质谱技术、流式细胞技术、芯片杂交、定量PCR、免疫印迹和荧光、固相免疫电泳等十余项先进技术。
学科团队：
科室现有人员117名，其中正高2名、副高14名，博士14名，硕士31名。博导1名，硕导12名，是重庆市技术力量最雄厚的学科团队，科室为本专科博士、硕士学位授予点。
科研教学：
近年来先后承担国家优秀青年基金1项、重庆市杰出青年基金1项、国家自然科学基金20项；所有在编博士全部获得国家自然科学基金项目，在SCI期刊上发表论文90余篇；获中组部万人计划，科技部中青年科技创新领军人才，重庆市高层次人才特殊支持计划-青年拔尖人才等高端人才称号；获重庆市自然科学二等奖和重庆市科技进步三等奖各1项、授权专利3项。
每年承担了本科生、专科生的《检验与临床》《分子诊断学》《实验室管理》和《专业英语》等课程的教学；参与全国检验医学本科统编教材和《全国临床检验操作规程》等的编写，其中主编、副主编各1人、参编8人。同时还承担重庆市规范化医师培训的理论大课教学和临床实验带教、重庆市全科医学教育中心的理论大课等教学工作。
特色亚专业：
检验科目前形成了临床微生物学、分子生物学和临床化学技术为学科特色的特色优势亚专业。
临床微生物特色亚专业：
亚专业概况：
临床微生物学实验室拥有PREVIIsola全自动接种系统、全自动血培养系统、MALDI-TOFMS全自动质谱检测系统、Vitek2-compact全自动细菌鉴定及药敏系统、GeneXpert全自动PCR分析系统、Diversilab高级微生物基因分型系统、脉冲场凝胶电泳系统等国际先进的检测技术平台，覆盖了样本处理、培养、镜检、鉴定、药敏试验、血清学检测、分子生物学检测及菌株同源性分析等病原微生物检测各环节。
已形成微生物自动接种和染色平台、病原微生物快速鉴定药敏平台、少见及疑难病原菌分离鉴定平台、分子流行病学研究平台和联合真菌检测平台等先进完整的平台系统。临床微生物实验室是重庆市少见疑难菌鉴定及少见药敏表复核中心，拥有西南地区最大的病原微生物菌种保存库。
微生物团队有专业技术人员15名，其中正高职称1人，副高职称3人，博士4名，硕士3名。其中3人曾留学美国，3人曾在香港进修。以临床重要病原微生物感染的早期诊断技术、致病及耐药机制为研究方向，开展了一系列成绩卓著的临床研究工作。2011至2017年间在临床微生物与感染病学领域先后承担国家科技重大专项子课题2项和国家自然科学基金项目17项，发表SCI论文30余篇。
作为重庆市细菌耐药监测中心、重庆市真菌病监测中心和重庆市医学检验科医疗质量控制中心，实验室承担了各类培训班、专家送技术下基层、临床微生物学术沙龙、免费为基层单位提供疑难病原菌的鉴定和耐药菌复核等培训工作，同时承担了本硕博、规培进修生带教工作，定期开展小讲座，严谨的学风、耐心的讲述、丰富的内容获学生好评。近五年已培养来自全国各地的进修生共129名。
参与学术著作《临床微生物学手册》的翻译及《临床微生物学检验》的编写工作，并多次参编《临床微生物学实验室建设基本要求专家共识》《细菌与真菌涂片镜检和培养结果报告规范专家共识》《常见细菌药物敏感性试验报告规范中国专家共识》等微生物诊疗规范指南。
自2014年获批CARSS实践培训基地以来，依托基地强大的技术平台支撑，连续举办了11期实践培训班，已培训来自全国各地的学员共111名。为了让学员们学到扎实有用的知识，培训班采取1.模块式内容设计：特设临床微生物标准化操作、细菌耐药监测、疑难少见病原菌检测、临床沟通MDT、临床科研五大模块。2.带教方法创新：导师负责制、趣味教学比赛、带入式互动教学。3.培训形式创新：理论培训、实践操作、直接现场三者结合。教学模式受到100%学员的高度好评！
特色技术：
（1）艰难梭菌检查：
1、技术优势：
抗生素相关性腹泻是医院感染的常见并发症，艰难梭菌是主要病原菌。作为条件致病菌的艰难梭菌在抗生素、免疫抑制剂或化疗药物的使用以及免疫力低下等危险因素的作用下可在肠道中大量繁殖，并通过A、B毒素及两性毒素的产生导致抗生素相关性腹泻以及假膜性肠炎等症状疾病的发生。临床上艰难梭菌的培养分离极其困难，技术要求较高，我国只有北京、上海、湖南、香港及台湾等地区的少数医疗机构开展。医学检验科率先在西南地区开展艰难梭菌的分离培养检测技术，填补了西南地区空白。
医学检验科采用生物梅里埃试剂盒结合VidasMini仪器对粪便标本进行直接毒素检测，该方法检测时间短（24小时内出结果），特异性高（可达95%）但敏感性欠佳，为弥补其敏感性不理想的缺点，我们同时采用艰难梭菌检测的金标准培养方法进行检测。将粪便标本经过特殊前处理后采用专用的筛选培养平板对艰难梭菌进行培养分离，与常规培养方法比较该方法能够大大提高该菌的阳性分离率，有效避免毒素检测漏检情况的发生。通过上述两种方法的结合，我们已建立起一个兼顾时效性、特异性及敏感性的检测平台，本技术西南地区领先。
2、临床应用：
该技术开展以来，已接收来自重症ICU、重症外科ICU、神经外科、骨科、胃肠外科、呼吸内科，神经内科、消化内科及肾脏内科等科室标本175份，共成功分离到28株艰难梭菌菌株（其中毒素阳性标本16份），总体分离率达15%，接近北京上海及湖南地区20%的分离率，其中部分科室分离率可达40%左右。有效协助临床医生针对抗生素相关性腹泻的病因学诊断，并进行针对性用药，抑制了抗生素滥用情况的发生。本技术在重庆医科大学附属第一医院临床得到成功推广应用。
（2）快速质谱检测技术：
1、技术优势：
基质辅助激光解析/电离飞行时间质谱（MatrixAssistedLaserDesorptionIonizationTimeOfFlightMassSpectrometry，MALDI-TOFMS）是临床常见病原体（如细菌、酵母菌、丝状真菌、分枝杆菌等）快速鉴定的特色技术，医学检验科是包括协和医院、301医院、西京医院、南京军区总院等国内首先开展本项技术的少数几家医院。
本技术与常规的鉴定方法相比，最突出的优势是快速、准确、操作简便。与传统手工检测时间和常规仪器自动检测的时间比较，VITEKMS检测只需挑取培养基上单颗菌落涂板即可用于进行鉴定，如对于细菌而言，VITEKMS全自动快速微生物质谱检测系统鉴定一个样本仅需一分钟左右，可以同时检测4个标本板192个样本，与传统的鉴定手段（24-48小时）和仪器自动检测（2.5-24小时）相比，显著缩短了鉴定时间。此外，由于MALDI-TOFMS鉴定所需菌量极少，因此可以通过离心、细胞裂解等方法，直接提取血液、无菌体液、尿液中的细菌，无需经过12-24小时在培养基中分离生长的时间，进行MALDI-TOFMS鉴定，还可进一步缩短鉴定时间。
MALDI-TOFMS配套数据库包含2000多种细菌、真菌等菌株信息，与传统鉴定方法相比，对少见菌、疑难菌的鉴定能力显著提高。此外，MALDI-TOFMS也是医院感染暴发菌株的同源性分析的先进平台（院感暴发常有同一克隆株流行引起，而相同克隆株的蛋白指纹图谱具有高度一致性，因此可通过软件分析菌株的蛋白指纹图谱相似性快速判断是否为院感暴发流行）。
2、临床应用：
实验室应用MALDI-TOFMS对临床分离病原菌的常规鉴定，自开展以来，共完成临床菌株鉴定49000余例，包括革兰阴性杆菌34000余例，革兰阳性球菌11000余例，酵母菌约5000例，细菌平均鉴定时间从传统生化鉴定的3-8小时缩短到6-15分钟，真菌平均鉴定时间从传统生化鉴定的12-24小时缩短到10-20分钟，其中含少见菌、常规方法未能鉴定的疑难菌等，为临床感染的诊断提供了明确的病原学依据。
2014年初医学检验科以MALDI-TOFMS技术平台建立了重庆市少见疑难菌分离鉴定中心，为重庆市其他医院提供细菌鉴定服务，至今共为重庆市其他10余家医院检验科提供少见、疑难菌分离鉴定服务50余次，鉴定病原菌包括酵母菌、厌氧菌、奴卡菌、非结核分枝杆菌等。为临床感染的病原学诊断和合理应用抗生素提供了快速、准确的实验室依据。
临床分子生物学特色亚专业：
1.亚专业概况：
临床分子生物学亚专业是重庆市最早建立的分子生物学实验室之一，2004年通过卫健委临床基因扩增实验室验收；2010年通过卫健委临床基因扩增实验室复评审；2013通过重庆市二类医疗技术验收。实验室现有工作人员8名，副高3名，博士2名，硕士3名。获得国家自然科学基金、教育部重点课题、重庆市自然科学基金等多项研究课题，在SCI和国内核心期刊上发表研究论著数10余篇。
临床分子生物学亚专业拥有基因扩增技术、荧光原位杂交技术、流式细胞技术、芯片技术、基因测序等先进完整的分子生物学技术平台。新冠疫情防控中在重庆市医疗机构中首批开展新冠病毒核酸检测，目前检测量在重庆市名列前茅。在新冠援外抗疫中，本亚专业是重庆市派出人员和提供设备最多的医疗队。在支援北京和新疆新冠核酸检测的工作中均作为领队单位承担组织实施任务，工作中成绩突出，收到当地医院和重庆市卫健委的高度好评。
2特色技术：
（1）流式技术：
1、技术简介：流式细胞仪是采用荧光标记的单克隆抗体，对标本进行多色染色，获取被标记的阳性细胞，具有很强的特异性，灵敏度。
2、临床应用：①白血病分型、肿瘤疗效监控、艾滋病免疫状况的检测等；②T淋巴细胞绝对计数，用于患者免疫状况的精确检测，如白血病、肿瘤、艾滋病等，本技术已在重庆医科大学附属第一医院临床常规应用。
（2）HLA分型技术：
1、技术简介：采用序列特异性引物扩增HLA等位基因的特异性片段，经电泳分离，根据PCR扩增电泳结果判断被测标本的HLA等位基因型，可反映HLA抗原水平的等位基因类型，是器官移植组织配型的必指标，该技术具有通量大、正确性好的特点。
2、临床应用：从本技术开展以来，临床应用HLA分型的技术进行配型效果良好，满足了重庆医科大学附属第一医院及院外器官移植病人配型需求，保证了患者的快速康复和移植存活率。
（3）基因芯片技术：
1、技术简介：该技术高通量地将大量探针分子固定于支持物上后与带荧光标记的DNA进行杂交，根据杂交信号强度进而获取样品分子的数量和序列信息，该技术具有检测通量大、灵敏度和特异性高等优势。
2、临床应用：实验室开展的本技术主要于。①分枝杆菌菌种鉴定：可同时对17种/群临床常见分枝杆菌进行快速鉴定，及时为临床提供分枝杆菌致病菌种类型，为临床精准治疗赢得时间。②结核分枝杆菌耐药基因检测：采用基因芯片检测技术，快速检测rpoB/katG/inhA的基因突变，结果可为一线抗结核药物利福平和异烟肼的耐药情况进行评估，为临床调整用药方案提供依据。至本技术开展以来每年提供约2000人次的检测。
（三）临床化学特色亚专业：
临床化学是检验科自动化、信息化程度最高、工作量最大、发展迅速的亚专业学科。临床化学实验室现有专业技术人员11人，其中正高职称1人，副高职称2人，博士3名，硕士3名。亚专业带头人曹炬2017年获国家优秀青年基金1项（呼吸系统感染领域首位获得者），发表SCI论文20余篇，单篇SCI最高影响因子达13.2，申请中国发明专利3项。
唐曦，白顺杰博士各获得国家自然科学基金青年基金1项。承担重庆市医学检验质量控制中心盲样比对生化标本准备及回报结果的分析工作。参与了多层次临床化学教材的编写工作，成为以临床、教学为主，兼顾科研的大型临床化学实验基地，为临床科研提供强有力的实验技术支持。
临床化学实验室拥有Rochecobasc8000全自动流水线生化免疫检测系统、sebia毛细管电泳仪、sebia琼脂糖电泳仪、RocheE602电化学发光免疫分析仪、贝克曼IMMAGE特种蛋白分析仪、西门子IMMULITE1000化学发光分析仪、BNⅡ特殊蛋白分析仪、PremierHb9210糖化血红蛋白仪等大中型先进检测设备，开展检验项目140多项，室内质控覆盖率100%，室间质评参加率100%，通过率98%以上。形成了完善的质量控制体系，通过实验室持续信息化建设和检验结果自动审核等工作的实施，能够快速、准确地完成临床化学检验，是重庆市临床化学规范化管理“示范实验室”。
2.特色技术：
（1）多发性骨髓瘤检测技术平台：
1、技术简介：多发性骨髓瘤检测常用血清蛋白电泳、免疫固定电泳、血清及尿液游离轻链定量检测、本周氏蛋白检测，各种检查手段相互补充，组成完善的检测平台。血清蛋白电泳是临床上分离检测血清中各蛋白质组分最简单的方法，通过血清蛋白电泳可以获得血清蛋白质各组分的图谱，正常血清蛋白电泳后分为白蛋白、α1、β、γ球蛋白5条区带，多发性骨髓瘤的患者常在γ区或β与γ区之间出现M蛋白区带，并且能检查出M蛋白所占的比例，是临床上早期筛检多发性骨髓瘤及指导治疗的常规筛选方法，但血清蛋白电泳检测M蛋白时常由于其敏感性不高的原因而容易漏诊。
免疫固定电泳的敏感性和特异性高，是临床上M蛋白检测的参考方法，能检测出血清中含量很少的单克隆免疫球蛋白，应用于早期诊断疾病的效果好，广泛应用于多发性骨髓瘤的鉴定分型及诊断，但免疫固定电泳不能定量，不能满足疗效评估和疾病转归预测；轻链型多发性骨髓瘤患者瘤细胞只能合成轻链，轻链可释放入血，由于其分子质量相对较小，经肾脏排出，血和尿中均可定性及定量检测本周氏蛋白（轻链型的M蛋白）。
多发性骨髓瘤检测技术平台的建立对M蛋白定性定量检测相互补充，各种检测手段各有优势，弥补各种方法学缺陷，有助于临床灵活选择多发性骨髓瘤的初筛、确诊及疗效评估检测。
2、临床应用：自该检测平台建立以来，医学检验科已收到血液内科、肾内科、骨科及感染科等多个科室的标本，总检测项次高达近4万次，临床对医学检验科的多发性骨髓瘤检测平台认可度高，检测结果可靠，多方法互补，有助于临床综合考虑减少漏诊率。而M蛋白的定量检测有助于临床对疗效评估和疾病转归的预测，深受临床普遍认可。
（2）免疫球蛋白lgG亚型测定技术：
1、技术简介：免疫缺陷相关疾病是一组免疫系统在发育分化或代谢等方面存在异常所引起的免疫功能不全综合征，临床以反复严重感染为主要特征，由于易伴有免疫自身稳定和免疫监督功能失常因而自身免疫性疾病过敏性疾病及恶性肿瘤的发病率高于于同龄正常人群。
以抗体缺陷为主的体液免疫缺陷约占原发性免疫缺陷的50%，IgG是血清中含量最高的免疫球蛋白，占70%-75%，也是最重要的抗感染分子，包括四个亚型，分别为lgG1、lgG2、lgG3和lgG4。各亚型具有各自特性和不同功能，共同完成机体抗感染作用。流行病学统计发现儿童和成人常见lgG亚型比例失调(一种或多种lgG亚型低于正常参考值或低于敏感方法的检测限)，临床表现出lgG亚型缺陷相关疾病。临床上因免疫缺陷而处于感染风险（如器官移植）或反复呼吸道感染等患者，即使lgG总水平正常甚至增高的情况均需进行lgG1-4亚型检测。
lgG4相关疾病常表现为单个或多个受累组织器官弥漫性或局灶性肿大、有相对特异的组织病理学表现，IgG4+细胞浸润、通常伴有血清IgG4升高（>135mg/dl）。这类疾病在临床中常因临床症状与其他疾病类似而误诊，如既往文献多次报道自身免疫性胰腺炎误诊为胰头癌。一旦确证为lgG4相关疾病，治疗后lgG4水平随病情好转而下降，因此，血清lgG4水平筛查有助于早期辅助诊断、反映病情及疗效。
免疫球蛋白lgG亚型测定技术的优势：鉴于lgG亚型测定的重要临床意义，医学检验科率先在重庆地区利用西门子特定蛋白分析仪，开展lgG1-4亚型测定，该技术具有如下优点：①采用先进的乳胶增强散射免疫比浊法，灵敏度超出传统方法学1000倍以上；②具有西门子公司自行研制开发的单克隆抗体试剂，使用独特的位点封闭技术排除异嗜性抗体干扰，保证检测结果的特异性；③采用独特的预反应检测原理进行抗原过量检测，有效地排除了假阴性结果；④精密度（即重复性）达到5%以下。
2、临床应用情况：自该技术项目开展以来，已接收来自呼吸内科、风湿免疫科、肾内科、耳鼻喉科、内分泌内科及肝胆外科等科室标本400百余份，且标本量呈现逐年上升趋势。结果反馈临床后，能有效协助临床医生针对反复呼吸道感染及自身免疫性疾病的病因学诊断，并进行针对性用药。
检验科秉承“严谨、高效、精准、创新”的质量方针和持续改进的理念，创新性建立了基于全流程（Processes）、全要素(Principle)、全岗位(Position)、全员工(Personnel)的“4P质量管理体系”；用“病人为中心、员工为主体”的质量理念，建立起完善的质量管理体系。建立完整的组织架构，管理岗位职责明确，通过建立岗位责任制、责任追溯制和绩效考核制的管理机制，保障管理体系的可持续发展。
检验科以“4P质量管理体系”为基础，建立起国际认可的双质量管理体系，是重庆市首家通过ISO15189和美国CAP认可的医学实验室。为对“4P质量管理体系”持续推广应用，科室对质量管理关键要素进行不断探索研究，发表30余篇相关研究论文，课题“医学实验室质量与能力体系及关键技术的建立与应用”获得重庆市科学进步三等奖。
作为重庆医学检验质量控制中心，将“4P质量管理体系”卓有成效地在重庆地区推广应用，建立了覆盖本地区的各区县质控中心网络系统，有力推动了本地区检验质量和人员素质的提升。2012年在全国率先提出关键质量指标管理，经近几年的推动和发展，重庆市检验质量控制和规范化管理走在了全国前列。
辐射能力：
（一）医疗方面：
检验科建立起全亚专业的业务团队，并建立起国际认可的双质量管理体系，规范化管理起在全国前列，是重庆市检验设备先进和技术平台最完善的临床实验室，年检测标本量处在重庆市前列。科室还对重庆和市外检验学科进行点对口帮扶，市外：对口帮扶西藏昌都市人民医院和海南万宁人民医院检验科，帮助帮扶医院顺利通过了三级和二级医院的评审。
市内：对城口县人民医院、大足区人民医院、綦江区人民医院、丰都县人民医院等10家医院进行现场指导帮扶，使帮扶医院顺利通过了等级医院的评审或创建。接收进生人员不断增加，近2年共接收进修生70余名；且来医学检验科进修生区域广泛，如：内蒙、贵州、四川、云南、重庆等多个省市及重庆市内各区县的二级或三级医院。
（二）全面完成公益或政府指令任务：
本专科多次接收完成国家和市政府指令性任务：1.担任重庆市征兵体检检验质量控制、培训指导及女兵体检任务，工作受到征兵办的肯定。2.参加医学救援应急任务（援鄂、援京抗击新冠病毒）。3.完成重庆市卫健委检验结果互认质量控制工作。4.高质量完成重庆市医学独立实验室现场调研指导任务。
（三）带动区域临床检验学科共同发展：
1.切实推进“检验结果互认”
检验质控中心根据市卫计委（渝卫办医发〔2014〕111号）要求，连续6年在全市开展“检验结果互认”新鲜血标本比对、人员培训和质量控制指导工作。与此同时，带动各区县检验质控中心也在本区域同步开展了“检验结果互认”新鲜血标本比对和质量控制工作，形成了市区两级“检验结果互认”质量控制体系。2017年共有112家医疗机构检验科参加比对，较2016年增加了32家单位（主要为自愿报名参加的区县二级医院、中医院、妇幼保健院、厂矿医院、第三方独立实验室和社区医院等）。
目前全市已有60家医疗机构的25个项目达到“检验结果互认”技术要求，为实现“检验结果互认”，助推分级诊疗提供了技术支撑。
2.落实关键质量指标常态化管理：
为推进检验质量指标的管理和应用，检验质控中心2017年建立了检验质量指标网络上报平台，各医院每月将科室的检验质量指标进行网络上报，统计分析，让质量指标管理常态化。目前已有80余家医院按时网络上报检验质量指标。
3.大力开展“精准帮扶”工作：
依据重庆市卫生和计划生育委员会办公室“关于开展医学检验质量控制‘精准帮扶春芽行动’”的通知要求，由市检验质控中心牵头，有效推动“精准帮扶春芽行动”项目，12家区县检验质控中心完成了“一对一”帮扶12家乡镇卫生院检验科。市检验质控中心帮扶城口、秀山、奉节、石柱、江津、潼南、丰都等十余家基层医院，形成了市区两级“检验精准帮扶”的常态化。
4.多学科联动推进耐药防控：
根据重庆市卫生和计划生育委员会办公室关于开展“重庆临床细菌耐药监测防控行动”文件精神，联合重症医学、药学、临床微生物学、医院感染科等多学科联动模式，共同遏制细菌耐药。通过不断的人员培训和帮扶指导，细菌耐药监测数据上报单位不断增加，数据质量不断提升，从2016年-2019年获国家耐药监测网优秀实践培训基地三连冠，以及优秀省级监测中心三连冠荣誉称号。
开办多期细菌耐药基础和提高培训班，为本地区和其他地区培养了大量临床微生物骨干人员。创新性开展重庆市CRE多中心合作研究，定期开展专题培训及专家送技术下基层活动。通过上述措施耐药监测数据上报率继续保持100%，在监测网单位不断壮大的前提下，数据合格率上升5.1%，为重庆市卫计委提供了高质量的耐药监测报告。
5.开展“大练兵、大比武”技能活动：
为配合国家卫计委和国家总工会开展基层大练兵和大比武活动，市检验质控中心和各区县检验质控中心从2016年起开展“基层大练兵、大比武”和“金显微镜”活动，在全市通过微信平台开展形态学培训，各区县检验质控中心在本区域同步开展相关工作。由质控中心牵头，将网络形态学培训的模式推广，成立了“金显微镜”形态学培训微信群，该群涵盖重庆各个层次检验人员的代表，每周一次的形态学培训活动参与人员超过1500人，目前“金显微镜”已经成为重庆检验届的一个人气品牌。