重庆医科大学附属第二医院妇科为重庆市重点学科，博士生授予点和博士后流动站，系全国头位难产基地，重庆市宫颈疾病诊治中心和重庆市妇科医疗质量控制中心。拥有床位90张，有知名专家、教授、博士生导师8名，主要从事围产医学、妇科内分泌、妇科肿瘤、老年医学、内窥镜手术诊治。

　　妇科以内分泌紊乱、不孕症及妇科肿瘤见长。对各种宫颈疾病的诊治达国内先进水平。开展腹腔镜、宫腔镜的妇科治疗。不育治疗中心开展不孕不育的检查、诊治、输卵管梗阻后复通术、排卵监测指导性怀孕、宫腔内人工授精、试管婴儿胚胎移植等。