重庆三峡中心医院病理科，自1980年从检验科独立分科以来，已经成为渝东北地区规模最大的病理科之一，在设备、技术、诊断水平和检查人次方面均处于渝东北地区领先地位，跻身于全国同级医院的前列。现科室位于急救分院9楼，建筑面积800余平方米，科室的医疗工作量一直居于重庆市前列，2020年完成各种病理诊断6万例，其中组织病理诊断3万余例，细胞病理诊断2万6千例，院外会诊500例。

科室医师技术力量雄厚，梯队合理，现有工作人员19人，其中副主任医师2人，主治医师5人，医师1人，副主任技师1人，主管技师5人，技师5人。硕士研究生3人。科室现有主任1名，副主任1名。有重庆市医学会病理专委会委员1名，万州区医学会病理专委会主任委员1名，副主任委员1名，万州区有突出贡献的中青年专业技术拔尖人才及万州区学术技术带头人1名。先后派出技术骨干到四川大学华西医院、第三军医大学新桥医院、大坪医院等院校进修学习，承担着本市及周边县疑难病理会诊、手术中冰冻切片、进修实习生培养等任务。

科室医疗设施先进，有装备精良的组织取材室、组织技术平台，拥有德国产LEICAASP300S自动组织脱水机一台、LEICA组织包埋机二台、德国产LEICA-2235轮转石蜡切片二台、德国产LEICA-2245轮转石蜡切片一台、LEICA-1900冷冻切片机一台、LEICA-1950冷冻切片机一台、SYMPHONY自动HE染色仪一台、DAKO全自动HE染色仪一台、DAKO免疫组化染色仪两台、罗氏免疫组化染色仪一台、LEICA双人共览显微镜一台、奥林巴斯五人共览显微镜一台、全自动薄层细胞制片机一套、原位杂交仪以分子实验平台及病理图像分析系统等。具有国内较为先进的病理取材室净化设备和病理标本贮存柜以及病理档案设备等。

在科室建设中，采用环保理念和科学流程，根据病理科工作性质的特点，在取材室及技术操室安装了空气净化器和通风设备，并对病理标本的取材和制样过程进行科学设计，合理设置工作流程，最大限度降低或消除了甲醛、二甲苯等有害物质对病理工作的人员健康的危害。是万州地区最早实现环保理念的病理科。

科室是渝东北地区病理诊断中心，也是万州区病理质控中心挂靠单位。可开展常规组织病理检查、术中快速冰冻病理检查、常规脱落细胞学检查、液基薄层细胞涂片检查、免疫组织化学及特殊染色检查、原位杂交、HPV高危分型、肿瘤基因突变检测等业务、技术，同时面向院内外提供疑难病例会诊及各种病理技术服务。2012年以来，获得免疫组化CCP全国质量认证和国家卫生计生委的质量认证：乳腺HER2、EGFR、KRAS及BRAF分子病理质量认证。同时建立了区域性病理远程会诊中心。

近年来，有4项科研成果获得万州区政府科技进步奖，其中一项获得重庆市卫生医学科技成果三等奖励。在国内期刊上发表论文30余篇，有多篇论文在全国学术会议交流。