西安市第九医院药剂科，承担着全院的药品供应、药剂管理、制剂配制及教学任务。科室下设有：门诊西药房、门诊中药房、住院药房、干部药房、传染药房、中心药房、普通制剂室、中药制剂室、药品检验室、细菌培养检验室、中西药库、临床药学室等。

有三十余篇论文分别发表在《中国医院药学杂志》等十余种杂志上，有二十余篇论文分别参加了不同级别的学术研讨会；重视质量管理，推动科室建设，曾先后荣获陕西省质量管理优秀成果二等奖三项、西安市质量管理优秀成果奖一项，郑州铁路局质量管理优秀成果奖七项。

2001年2月一次通过了普通制剂、中药制剂的验证工作，取得了《医院制剂许可证》；药剂科与临床共同研制的中药制剂“虎杖烫伤液”，经过二十余年的使用，临床反应很好，在治疗烧伤方面，证明有独特疗效；药剂科先后接受铁道部、郑州铁路局、陕西省卫生厅、西安市卫生局的行业管理和各项专业检查，均获得好评，在同行业中名列前茅。