华中科技大学协和深圳医院儿科，成立于1993年7月，由原来的6张床位，发展至目前88张床位，拥有儿科门急诊、儿科病房（一病区、二病区、PICU）的儿童医学中心，其中普儿78张，PICU10张。儿科门急诊年就诊量超过25万人次，每年收治病人3000余人，是目前深圳西部中心区域综合性医院技术实力最强的科室之一。

2005年起儿科承担广东医科大学、深圳大学医学院等高等医学院校的临床教学工作，2015年成立儿科专业基地，与北京大学深圳医院协同单位联合培养儿科住培医师。2017年，南山医院成功申报国家住院医师规范化培训主基地。2018年，首次以国家主基地---儿科专业基地身份面向全社会公开招录住培医师。

2014年儿科开展儿童肺功能检测，2017年成立PICU，开放床位10张。设吊塔式标准监护单元10个。配备标准监护单元、多功能监护仪、有创和无创呼吸机、彩色超声诊断仪、无创血液动力学监测仪、视频喉镜、亚低温治疗仪、多通道输注工作站、除颤仪等先进的危重症监护抢救设备。整体急救水平不断提高。2019年儿科开展儿童纤维支气管镜检查，为南山区儿科医疗技术突破，标志着儿科呼吸危重救治技术上了一个新台阶。

同年成立深圳市南山区儿科医疗联盟，作为联盟的龙头单位，通过技术帮带、双向转诊、学术交流等方式，发挥了专科的示范、辐射和引领作用。2019年专设“儿童哮喘标准化门诊”及创建深圳市儿童友好医院。

儿科的医护团队拥有浓厚的学术氛围和高水平的诊疗技术。曾先后承办国家级、省级、市级继续教育学习班；多次承担参与省、市、区级科研项目；撰写并发表科研论文100余篇。目前科室专业设置齐全，设有呼吸、急救、内分泌、神经、心血管、消化、肾脏、血液、过敏与免疫等专业组，其中呼吸、内分泌、急救、神经、消化、心血管、新生儿等专业人员配置及技术力量较雄厚。

儿科目前共有医护人员57人，其中主任医师4人、副主任医师18人、主治医师13人、住院医师3人，博士2人、硕士14人。住院部护士19人，其中副主任护师1人、主管护师10人、护师14人、护士4人，本科学历28人。科室分批多次派医护人员前往重庆医科大学儿童医院、广州市妇女儿童医疗中心进修学习，掌握了先进的急救技术和理念，整体急救水平不断提高。