深圳市儿童医院病理科是深圳市唯一一家专门负责儿童病理诊断的科室，为患儿的疾病诊断和治疗提供客观病理学依据“金标准”。同时，我院病理科也是全市儿童病理远程会诊的公共平台、牵头单位之一，深圳市医师协会病理科分会副会长单位，北京儿童医院集团的主要成员之一。2017年牵头制定的《儿童外周神经母细胞肿瘤的病理诊断共识》，为患儿（该类疾病）的规范化诊断提供了病理诊断标准。病理科现有建筑面积约800平方米，包括接诊室、综合技术室、免疫组织化学室、分子病理室、取材/标本存放/冰冻切片室、档案资料室、组织样本/细胞病理室、医生诊断室、读片会诊室、免疫荧光室、免疫组织化学室、分子病理室（附设在小儿血液肿瘤精准医学公共服务平台内）、医生诊断室和远程病理会诊室等。
我院病理科现有工作人员14名，医生6人，包括主任医师/博士/留美学者1名，副主任医师/博士1人，副主任医师/硕士1名，主治医师/硕士1名，主治医师/本科1名，住院医师1名；技术人员7人，其中主管技师/硕士1名，主管技师/本科1人，技师2名，技士2名，技术助理1人；文员1名。另有两名住院医师在外院规培。病理科人员配备及梯队建设合理，具有先进的病理诊断、科研设备。目前开展的工作，涵盖儿童病理诊断的所有领域，诊断方面包括组织病理、细胞病理、尸体解剖、分子病理、免疫病理和血液病理等诊断；技术方面开展常规HE染色技术、特殊染色技术、免疫组织化学、原位杂交、荧光原位杂交、免疫荧光、PCR技术和基因测序技术等技术。
病理科具有先进的诊断设备、领先的诊断技术和丰富的临床病理诊断技能，能够全心全意（高质量）地为广大患者提供准确的病理诊断，指导（为）患儿的诊断、治疗和预后评定提供客观依据，帮助患儿早日康复。
重要设备
病理科诊断科研设备先进、齐全，共有各类显微镜20台（含单人、双人、三人、五人和十一人共览显微镜）、全自动荧光原位杂交仪、细胞免疫芯片制备仪、冰冻切片机、全自动免疫组化染色仪、荧光定量PCR仪、自动核酸提取仪，自动核酸移液工作站、多功能显微镜及全自动特殊染色仪。
特色医疗
儿童血液肿瘤病理诊断
儿童分子病理诊断
儿童肌活检病理诊断
儿童肾活检病理诊断
儿童细胞免疫芯片诊断
新技术
1.2015年FISH技术在儿童肿瘤病理诊断中的应用
2.2016年细胞免疫芯片技术在儿童免疫状态检测中的作用
3.2017年PCR技术在分子病理学中的应用。
科研成果
1.江贤萍，2014年儿童髓母细胞瘤的分子分型研究
2. 宋建明，2015儿童周围神经母细胞肿瘤临床病理分子分型探究
3. 曹娟，2017年RNA 干扰 Surviving 基因表达对诱导儿童胚胎性横纹肌肉瘤 RD 细胞凋亡的影响
论文发表
2014年至今已发表论文18篇，其中2017年病理科共发表论文3篇
1.江贤萍等。免疫组织化学标记在儿童髓母细胞瘤分子分型中的应用及其临床意义 ,临床与病理学杂志，2017;37（1）1：79-86
2. 江贤萍等。儿童髓母细胞瘤组织中生长因子受体结合蛋白２的相关接头蛋白１、胶质瘤相关肿瘤基因同源物１表达的临床意义，中华实用儿科临床杂志，2017；32（2）：199-203
3. 宋建明等。 外周神经母细胞性肿瘤病理诊断共识，中华病理学杂志，2017；46（7）：459-464
学术交流
市级继续教育项目
1. 儿童病理专题学术讲座-炎症性肠病，2017-4-11 2. 2017年儿童病理诊断规范新进展学习班，2017-11-14 院内学术活动 1. WHO and How :implementing the WHO Revised 4th Classification of Embryonal Tumors 主讲人：洛杉矶儿童医院Alexander R. Judkins，2017-6-27