昆明医科大学第一附属医院儿科创建于1946年，经过几代儿科医师的奋斗和努力，现已发展为昆明医科大学第一附属医院集临床、教学、科研和保健为一体的优势发展学科。
1998年被云南省卫生厅授予为云南省儿科唯一的重点学科，是云南省精品课程和昆明医科大学一类课程教研室，云南省首家儿科硕士学位和博士学位授予点，云南省儿科疾病诊疗质量控制中心，云南省儿童内科疾病研究中心，新生儿疾病筛查中心，云南省儿科住院医师培养基地，云南省儿科医师继续教育培训基地，云南省妇幼医师培训中心，云南省中西医结合基地儿科临床组和世界卫生组织资助的卫生部腹泻病病例管理培训中心。
新生儿学是儿科学重要的组成部分，儿科是云南省建立新生儿病房和NICU最早的科室之一。通过建设，目前科室有完善的组织管理规划，确定本专业发展目标为：充分发挥综合大型教学医院多学科优势，构建有组织、高水平、高效率的新生儿救治网络，向云南省各基层单位、其他西部省份甚至东南亚国家辐射，进一步降低我国西部地区新生儿的死亡率和病残率。
目前已形成以新生儿/儿童急救、9个亚专业、与产科联合的母婴医学中心和儿童保健为一体的学科，于2012年经云南省卫生厅批准为云南省儿童医学中心。2013年评为云南省儿科疾病诊疗质量控制中心。2015年成功申报到国家发改委投资新建云南省儿童医学中心的资金，2015年通过擂台成功成为“省级临床重点专科建设项目—新生儿专科”单位。2015年获准建立云南省第一批院士专家工作站：孙波专家工作站。
在医院的支持下，进一步完善儿科病房规范化建设和高级别新生儿/儿童重症监护病房（IIIb级新生儿病房）的建设，随着呈贡新医院的启用，儿科住院病房的病床数将增加到250张。进一步探索代表国际先进水平的新生儿学领域的诊疗指南和临床路径，提高对严重威胁新生儿生命健康的主要危急重症如新生儿呼吸衰竭、极低或超低体重儿、新生儿神经系统疾病、新生儿感染和败血症、新生儿心脏、脑或胸腹部外科疾病围手术期诊断和监护等的综合救治水平，以不断提高专科医疗服务能力。
强化人才队伍建设，提高专业技术水平，创造条件并鼓励人员，深造和进修学习，努力造就一支精通业务、作风务实、结构合理的医疗护理专业队伍；开展临床新技术，如开展床旁超声无创血液动力学监测和肺部疾患的诊断，完善新生儿脑损伤干预体系，建立临床遗传诊疗中心。加强教学科研，与国内外知名研究机构合作（法国INSERM实验室，上海复旦大学儿科医院等），提高科研水平。
争取在3年内为云南省及周边地区培养博士研究生，继续培养专科硕士研究生、本科生和进修医师。开展各种水平的培训班，并与地州专科合作，使高水平、高质量的专科服务能够惠及边缘地区群众，对周边有辐射作用。
目前学术团体的主要任职：中华医学会儿科分会新生儿学组委员，中华医学会儿科分会小儿急救学组委员，中华医学会儿科分会消化学组委员，中国医师协会重症医学医师分会儿科专业工作委员会委员，中国医师协会新生儿专业委员会委员，中华预防医学微生态医学会儿科学组委员，西南区免疫规划协作委员会专家组成员；云南省医学会儿科学会副主任委员，云南省医学会围产医学会副主任委员，云南省医学会遗传学会副主任委员，云南省医学会危重医学分会儿科重症学组组长。
同时也是云南省医学会变态反应分会委员，中国医师协会云南省儿科分会副主任委员。云南省优生优育妇幼保健协会常务理事，云南省母婴保健技术鉴定委员会专家，云南省医疗事故鉴定委员会成员，云南省预防接种异常反应、药物不良反应鉴定专家库成员，云南省急性驰缓性麻痹分类鉴定专家协作组专家，云南省艾滋病专家治疗组妇儿组委员，云南省手足口病防治专家组副组长，云南省三聚氰胺结石防治专家组成员和新生儿窒息复苏省级培训教师。
《中华儿科杂志》、《中国实用儿科杂志》、《临床儿科杂志》、《实用儿科临床杂志》、《中国当代儿科杂志》、《中国新生儿科杂志》、《中国儿童保健杂志》和《昆明医学院学报》编辑委员会委员。
目前编内医师总人数38人，其中：正高职称7人，副高职称5人，中级职称9人，初级职称17人。具有博士学位2人、具有硕士学位24人，硕士或硕士以上学带历占68%。目前博士生导师1人，硕士研究生导师7人，其中云南省中青年学术技术带头人后备人才1人，省级高等学校教学科研带头人1人，云南省卫生高层次人才1人，国外留学归国人员9人。每年招收10余名研究生，已培养硕士研究生60余人。护士72名，副主任护师2人、主管护师7人、护师48人，护士15人。目前科室形成了年龄、结构配置合理的学术团队和人才梯队。
儿科专业齐全，配备合理，分为临床、内设机构和儿科教研室三个部分：
临床包括住院部和门诊：本部住院部拥有病床数136张，呈贡医院99张病床（实际开放床位36张），设有9个亚专业（新生儿、呼吸、消化和营养、肾脏/风湿免疫、血液肿瘤、心血管、神经、内分泌、医学遗传专业），2个重症监护室：儿科重症监护室（PICU）及新生儿重症监护室(NICU)并与产科共建云南省母婴医学中心。门诊分为平诊，专家，专科门诊，急诊，门诊观察室输液室和抢救室，实行7日24小时工作制。
科室门诊接诊患儿近89000人次/年，出院人数约5500人次/年，PICU收住危重患儿300人次/年，NICU收住705人次/年，危重患儿抢救成功率达到98.9%，DRGs5581.95，组数175，CMI1.28。取得了较好的社会效益。
儿科目前拥有云南省3个内设机构：云南省儿童内科疾病研究中心，云南省儿童神经研究实验室，云南省新生儿疾病筛查中心。研究中心内设有设备配备完善的分子生物实验室，遗传疾病实验室，小儿神经电生理实验室和临床技能实验室，开展着多项科研研究和临床检查。新生儿疾病筛查中心负责我省6个州44个县约11万人次/年的新生儿疾病筛查、诊治和随访工作。
多年来承担国家级和省级科研课题研究和国际合作研究项目，多次获国家级、省级和院级科研成果奖。近五年来在国家自然科学刊物上共发表论文共180篇，其中核心期刊发表论文40余篇，SCI收录6篇；获省级科研成果二等奖2项，三等奖4项，厅级科研成果5项。
儿科教研室承担着昆明医科大学、海源学院和昆医成教院本科儿科学授课、见习和生产实习的教学工作，年授课学时平均达1450学时；也承担着儿科专业硕士研究生、博士研究生的培养和儿科进修医师培养工作，迄今共培养硕士研究生约80名，已毕业研究生60余名，分布在国内外各级大学医院、研究所，其中部分人员已成为同领域的佼佼者；每年接收25-30名进修医生到儿科进修，为我省培养输送了大量的中高级儿科临床医生，目前大多数已成为各家医院学科带头人或业务骨干。
科室2003年获全国巾帼文明示范科室，多次获得昆明医科大学优秀教研室，多名教师在中青年中外文和专业技能讲课比赛中获得校级和院级一等奖。
昆明医科大学第一附属医院儿科是具有较强综合实力的省级重点学科，随着儿科医学的迅速发展，儿科培养了一批从事儿科专业的医护人员，整体技术实力雄厚，借助昆明医科大学第一附属医院强大的各专业学科和辅助科室，多年来承担着繁重的来自全省市、地州和邻近省份患儿的救治、会诊和转诊工作，还承担着东南亚国家（如马来西亚等）住云南省外籍人员的医疗保健和救治任务。目前科室汇集了省内儿科领域的权威专家和学者，遵循与国际接轨的医学模式和技术，对儿科各个专业的疾病和疑难危重症有丰富的诊治经验、独特之处和相关的科学研究。
特别在新生儿/儿童危重症救治和管理，小儿白血病、儿童哮喘和儿童社区获得性肺炎诊治质控和系统管理，小儿肾脏疾病、神经系统疾病、消化系统疾病、结缔组织性疾病和内分泌疾病规范性诊治等方面水平处于省内领先或先进地位，成为云南省危重儿童转诊、会诊和培训中心，云南省儿科医学领域疑难杂症的权威诊疗机构。