新疆维吾尔自治区肿瘤医院肺内科目前有两个病区，分为肺内科一病区和肺内科二病区。其中肺内科（一病区）开设病床58张，共有医师11人，护理人员19人，肺内科（一病区）主任单莉教授是新疆维吾尔自治区肿瘤医院“肺癌多学科诊治（MDT）团队”首席专家。

新疆维吾尔自治区肿瘤医院是肺内科一病区新疆地区唯一一个肺癌专病治疗科室，在肺癌的诊疗领域有丰富的临床经验及科研积累。科室遵循国家卫计委颁布的肿瘤诊疗规范，践行胸部肿瘤的MDT诊疗模式，为患者提供个体化、规范化的综合治疗方案。肺内科（一病区与病理科合作开展了肺癌组织EGFR、ALK、ROS1基因突变检测。外周循环血（ctDNA）EGFR基因突变检测为无法获得组织学标本进行基因检测的肺癌患者带来了一线曙光。科室开展的内科胸腔镜检查经济、安全，检查阳性率明显高于传统的胸腔穿刺细胞学检查，显著提高了胸腔积液及胸膜疾病的诊断率。作为国家卫计委药物临床试验基地参与了多项全球/全国多中心肿瘤新药的临床试验。

新疆维吾尔自治区肿瘤医院肺内科二病区开设病床59张，现有32名医护人员，其中医疗人员13人，护理人员19人。形成了以化学治疗为主，分子靶向治疗、免疫治疗、姑息对症等于一体的特色和优势，在肺部肿瘤疑难病例诊断及个体化的治疗方面积累了丰富的临床经验，在这一领域水平目前国内先进，全疆领先。科室全面推行肺部肿瘤规范化综合治疗，与国际先进治疗方法接轨。积极倡导和践行肺部肿瘤的多学科协作诊治（MDT）模式，同外科、放疗科、影像诊断科、病理科等专家参加疑难病例讨论，为患者提供合理的个体化的综合治疗方案。于2010年被批准为卫生部药物临床基地,主持或参与了多项国内外Ⅱ、Ⅲ临床研究。

2012年被卫生部批准为“疼痛规范化治疗示范病房”，与中国医科院肿瘤医院、中山医科大学附属肿瘤医院、上海复旦大学附属肿瘤医院等多所国内著名肿瘤专科医院建立人才培养与交流项目，多名医师有国内外深造经历，形成了良好的人才梯队，保证了学科的可持续发展。科室近5年撰写SCI论文多篇，国家级核心期刊30余篇。取得省部级课题10余项。