新疆医科大学第二附属医院肛肠外科创建13余年，目前已往以微创手术为特色的专科方向发展。目前科室有5名医生，其中主任医师1名、主治医师3名、住院医师1名、硕士研究生3名。

肛肠外科诊治范围：1内痔、2外痔，3混合痔、4肛瘘、5肛周脓肿、6大汗腺炎、7肛周湿疹、8肛窦炎、9藏毛窦、10肛门乳头瘤、11肛裂、12直肠粘膜脱垂（内脱垂、脱肛）、13直肠前突、14结直肠息肉、15便秘、16溃疡性结肠炎、17结肠炎、18直肠阴道瘘、19大便失禁、20直肠狭窄、21坏死性筋膜炎、22骶前肿瘤、23会阴裂伤、24各类复杂性肛瘘。