新疆医科大学第五附属医院职业病防治科1990年6月正式成立，1991年由铁道部卫生环保司专家论证，被列为铁道部重点专科。2004年经自治区卫生厅验收审核，批准为自治区首批职业病诊断机构。是自治区唯一一所拥有职业病临床机构的三级甲等医院。

职业病防治科现设立职业病专科门诊，设有病床20张，医护人员12名，其中副主任医师2人，主治医师4人，主管护师6人，均具有10年以上丰富的职业病专科临床经验及较高的职业病诊治水平。其中五人获得国家尘肺病及职业中毒诊断医师资格。两人分别为自治区职业病鉴定专家组和医疗事故鉴定专家组成员。

职业病防治科拥有心电监护仪、肺功能仪、心电图机、各种雾化治疗仪等先进的医疗设备。开展了各类职业病的预防、鉴定、诊断、治疗。如：职业健康监护（对接触粉尘、有毒物质、物理因素等人员进行健康检查）；农药生产使用过程中职业危害的预防；肺功能检查等多种检查项目。

目前采用中西医结合、理化等治疗措施对各种职业病都有独特的治疗方案，取得了显著的疗效。职业病防治科全体医护人员以崇高的职业道德，精湛的医疗技术和优质的服务态度，为每一位患者提供满意的服务。