内蒙古自治区人民医院胸外科于1984年与大外科分开成为独立科室，1991年科内自己独立完成体外循环下心内直视手术，1992年自己完成二尖瓣置换术，1993年开展腹主动脉瘤切除人工血管移植术，体外循环下冠脉搭桥术（获院内奖），胸外科有人员23人（医生11人，护士12人），开放床位36张（正式床位24张，恢复室8张，心脏ICU4张）。

胸外科擅长各种胸外科常见病及多发病的诊治，各种胸外伤的抢救，各种胸外科危重病人的抢救。开展食道癌、肺癌、胃癌的根治手术，电视胸腔镜下胸部手术，肺大泡切除术、食道平滑肌瘤切除、胸腺瘤切除、手汗症、肺楔形切除、清创术等。设备配置有体外循环机、呼吸机、体外起搏器、体内外除颤器、微量输液泵、血气分析仪。