中国医学科学院肿瘤医院深圳医院胸外科是深圳市医疗卫生“三名工程”的重大项目单位，科室直接依托国家癌症中心、中国医学科学院肿瘤医院胸外科开展工作，一期设置3个病区，105张床位，二期将再增加3个病区共210张床位。中国医学科学院肿瘤医院深圳医院胸外科技术力量雄厚，拥有一支由30余名医护人员组成的强大医疗、护理团队，包括主任医师3人，副主任医师3人，主治医师2人，住院医师2人，其中博士4人，硕士4人;其中主任副主任医师均为中国医学科学院肿瘤医院胸外科全国知名专家，全职在我院工作，科室青年骨干均在中国医学科学院肿瘤医院胸外科完成系统强化训练，熟练掌握胸部肿瘤外科规范化诊治理念与技术。
学科带头人赫捷院士为中国科学院院士，主任医师，博士和博士后导师。现任中国国家癌症中心主任，中国医学科学院肿瘤医院院长兼党委书记。

担任亚洲胸外科医师协会创始主任委员，中华医学会胸心血管外科学分会候任主任委员，中国医师协会胸外科分会候任会长，中国临床肿瘤学会(CSCO)副理事长，《ATSJournal》《中华肿瘤杂志》等杂志主编。

长期致力于肺癌、食管癌等胸部肿瘤的早诊早治及规范化诊治系列研究，制定我国行业规范化诊治指南和标准，编写多部肺癌、食管癌专着，主持973、863、国家重大专项等课题，成果获2013年度国家科学技术进步奖一等奖。
胸外科拥有设施齐全、服务一流的现代化住院病房。

目前拥有胸腔镜、腹腔镜、纵隔镜、电子纤维支气管镜、电子食管镜、移动式X线机、心电监护仪、除颤仪、振动排痰仪、运动心肺功能仪等先进设备;E-BUS、PET-CT、达芬奇机器人、电磁导航支气管镜等先进大型设备也将在近期配备并应用于临床。
胸外科以肺癌、食管癌和纵隔肿瘤的诊断、综合治疗为工作重点，并且在肺良性肿瘤、食管良性肿瘤、气管肿瘤、贲门癌、胸壁肿瘤等其它胸部疾病的外科治疗方面处于国内领先地位。
胸外科已开展的常规手术包括开放及微创下的各类肺癌根治(肺叶或全肺切除、袖状切除、支气管及血管成形)、食管癌根治、贲门癌根治、食管平滑肌瘤切除、纵隔肿瘤切除、胸壁肿瘤切除术等。

除此之外，胸外科还在以下三个领域形成了自己的技术特色和优势：1.单孔胸腔镜手术：科室胸腔镜手术比例超过80%,尤其是单孔胸腔镜手术，通过一个3-4cm的小切口就可以完成各种肺、食管、纵隔肿瘤切除以及肺癌的全肺、肺叶、肺段、袖状切除和胸壁肿瘤切除等复杂手术;2.胸腹腔镜联合食管癌根治术：联合胸腔镜和腹腔镜完成中上段食管癌根治术，避免了常规开胸开腹手术带来的巨大创伤，此技术在国内外处于领先地位;3.胸外科高难、复杂手术：在肺上沟瘤切除、巨大胸壁肿瘤切除重建、气管肿瘤切除、隆突切除成形、上段食管癌切除、结肠代食管术等方面经验丰富。
特色技术
技术特色和优势：
1.单孔胸腔镜手术：科室胸腔镜手术比例超过80%,尤其是单孔胸腔镜手术，通过一个3-4cm的小切口就可以完成各种肺、食管、纵隔肿瘤切除以及肺癌的全肺、肺叶、肺段、袖状切除和胸壁肿瘤切除等复杂手术;
2.胸腹腔镜联合食管癌根治术：联合胸腔镜和腹腔镜完成中上段食管癌根治术，避免了常规开胸开腹手术带来的巨大创伤，此技术在国内外处于领先地位;
3.胸外科高难、复杂手术：在肺上沟瘤切除、巨大胸壁肿瘤切除重建、气管肿瘤切除、隆突切除成形、上段食管癌切除、结肠代食管术等方面经验丰富。