中日友好医院口腔医学中心成立于2011年12月，下设口腔全科、口腔正畸科、口腔内科、口腔颌面外科、口腔修复科五个科室。2012年6月底，从B栋搬至M栋，从此口腔医学中心占据M栋3、4、7三层，规模从30台牙椅扩大至80台牙椅。2013年成为《口腔全科医学杂志》主办单位。2015年成为中华口腔医学会口腔全科专委会主任委员单位。2015年底成为北京大学口腔医学院八年制临床教学实习基地。
科室人员构成：
科室主任为徐宝华，科室副主任为张晔、于岚，护士长为彭佳、石伟伟。主任医师6人，副主任医师9人、主治医师16人、住院医师36人、技师16人、护士85人、行政1人。获得博士学位的医师有33人，博士后1人，硕士16人。口腔医学中心是中华口腔医学会全科口腔专委会主委单位，中国整形美容协会牙颌颜面医疗美容分会主委单位，及《全科口腔医学杂志》主编单位。
门诊、病房设置：
口腔颌面外科现有开放病床10张，诊治疾病包括口腔颌面部肿瘤，颌骨和软组织囊肿，涎腺(腮腺、下颌下腺、和舌下腺)肿瘤，颌面部创伤和上下颌骨、颧骨、颧弓、眼眶骨折，口腔颌面部感染，正颌外科等。目前承担北京市“首都临床特色应用研究”一项，项目名称“下颌下腺转移预防头颈癌患者放疗后口干的临床研究”。
科室诊疗特色：
1、全科口腔医学专业
作为国家级大型综合医院，中华全科口腔医学专业委员会副主任委员单位，科室在口腔疾病与全身疾病的综合治疗，以及口腔医学各专业的综合治疗方面处于国内先进水平，全科口腔专业涉及口腔内科(牙体牙髓、牙周、粘膜、儿童牙科)、颌面外科、修复科、口腔美学、口腔急诊，努力实现不换诊室就可以解决全部口腔问题的综合治疗目标。避免了患者在医院内各诊室奔波的烦恼，实行首诊负责制，为患者提供方便和全方位的口腔医疗服务。
2、口腔正畸学专业
在国内口腔正畸领域，科室在多项技术上具有明显优势，其中舌侧隐形正畸技术在国内处于领先水平，科室徐宝华教授已举办了七期隐形正畸技术学习班，为这项技术的普及推广起到了积极的作用。由徐宝华教授主持的“当代口腔正畸直丝弓矫治技术及徐氏滑动直丝弓矫治技术”是卫生部十年百项计划重点推广项目，这也是国内口腔正畸界首次入选项目。另外，口腔医学中心在成人口腔正畸、严重牙颌面畸形的早期矫形治疗方面均处于国内先进水平。种植支抗技术的应用是正畸发展的里程碑，科室种植支抗系统成功率在国内处于领先地位。
3、口腔种植学专业
科室开展口腔种植有十余年的历史，作为科室特色专科，成立了由外科医生、修复科医生，牙周医生组成的种植专科，可为患者提供系统全面的诊疗服务。所有主任、副主任医师及专科博士都曾在国外接受过系统正规的专业培训。
4、牙体牙髓病专业
科室拥有当今国际上先进的根管治疗技术及设备，对于钙化的及再治疗的患牙，普通的根管治疗往往无法达到满意的根管治疗效果，牙科手术显微镜、超声根管扩大技术、热牙胶垂直加压充填等技术，能极大提高牙髓病和根尖周病治疗的质量，使一些采用传统方法不能保留的患牙得到治疗和保留。
5、口腔修复学专业
修复科医技力量雄厚，技术设备先进，修复科承担着北京大学医学部临床实习的教学任务。现有副主任医师以上职称2人，博士4名。与国内外知名大学保持着密切的合作，把握世界修复技术的前沿，将修复技术和科研成果积极应用于临床工作中，在核心期刊上发表论文若干。
6、口腔牙周专业
牙周专业由牙周专科医师及洁治员组成，具有多年的临床牙周病治疗经验，严格按规范进行高质量的牙周病基础治疗，并结合多学科的综合治疗(牙体牙髓、修复、正畸)，取得良好、稳定的治疗效果，有效控制牙周疾病的进展，同时开展牙周美容手术、牙周植骨术，从而改善美观，提高生活质量，满足不同人群的牙周美容需求。目前，科室正在开展以预防、治疗、维护、种植、修复为一体的牙周病综合治疗模式，处于国内领先水平。
现有专病门诊：
口腔颌面外科门诊、口腔牙体牙髓、口腔种植、口腔正畸、口腔修复(镶牙)、口腔牙周、儿童口腔、牙齿美容冷光漂白。
科室科研成果：
1、由徐宝华教授主持的“当代口腔正畸直丝弓矫治技术及徐氏滑动直丝弓矫治技术”是卫生部十年百项计划重点推广项目，这也是国内口腔正畸界首次入选项目。
2、主持国家国际科技合作专项《国产数字化牙周病防治技术研发与应用》、国家自然科学基金面上项目《计算机辅助设计制作的个性化舌侧正畸矫治技术的设计与开发研究》、首特项目《首都特色-下颌下腺转移预防头颈癌患者放疗导致的放射性口干的临床对照研究》、青年项目《胶原/钙双亲多肽调控树脂牙本质粘结界面仿生再矿化的研究》、首都医学发展科研基金《计算机辅助设计制作的个性化舌侧矫正器的研制与开发》、首都临床特色应用专项《成人牙周病隐形正畸治疗》
3、《全科口腔医学杂志》主编，主持编写《现代临床口腔正畸学—骨性错合畸形矫治与成人正畸》、《现代口腔正畸学-科学与艺术的统一》、《社区全科口腔医师临床实践》等口腔教材及专著6部。
4、获“由预成舌侧托槽制作个性化托槽的方法及制品”、“用于矫正牙齿的矫正器托槽及颊管”、“五翼正畸托槽”等5项国家级发明专利；开发的国产化CAD/CAM舌侧矫治器产品已投入市场用于临床。
5、发表SCI十余篇，核心期刊上百篇。
科室教学情况：
2011年11月开始，成为北京市住院医师规范化培训基地。
2015年9月开始，成为北京大学口腔医学院八年制临床教学实习基地，是北大口腔院外实习基地。
2015年底，成为继北大口腔和北京市口腔两所单位之外的住院医师结业考核单位。
北京大学临床医疗系《口腔医学》临床大课和见习教学单位。
承担全国的进修医师和医联体单位、对口支援单位的进修培训任务。
科室获得荣誉：
荣获2014-2016年度国家卫生计生委直属机关“五四红旗团委(支部)”。
院内位置：
科室门诊位于综合楼M栋三层、四层、七层。
住院病房位于综合楼M栋六层。
科室电话：
口腔医学中心门诊服务台：(8610)84205365
口腔内科专家诊室：(8610)84205271
口腔外科专家诊室：(8610)84205371
口腔正畸科专家诊室：(8610)84205263
口腔修复科专家诊室：(8610)84205286
口腔技工室：(8610)84205366