首都医科大学附属北京朝阳医院泌尿外科组建于1958年，床位16张，最初作为大外科的一个专业组开展常规工作，同时在人工肾、肾动脉造影等技术方面也有尝试。1991年，泌尿外科成为独立科室，床位扩至23张，相继开展了肾盂成形、泌尿系肿瘤根治、体外冲击波碎石及前列腺电切等技术，并成功完成朝阳医院首例同种异体肾移植术。
1997年，依托朝阳医院泌尿外科成立首都医科大学泌尿外科研究所。1998年被评为北京市卫生系统重点学科，1999年开展胰肾联合移植，至今完成肾移植3000余例。近10余年，泌尿外科蓬勃发展，技术优势已从单一的肾移植向泌尿科各亚专业全面发展，并已经形成以专业组为依托，医教研全面发展的新格局，很多新业务、新技术全面铺开，尤其是泌尿系统肿瘤、结石等疾病微创治疗、盆底及排尿功能障碍治疗等方面，在全国处于优势地位。
泌尿外科现有医护人员116名，博士生导师2名、硕士生导师5名，教授3名、副教授15名、主任医师6名、副主任医师23名，具有博士、硕士学位的临床与学术骨干30余人，博士占医生总数的61%，硕士占26%。泌尿外科在朝阳医院本部开设两个病区，在西院开设1个病区，开放床位共112张，年门诊量10万余人次，年收治住院病人2500余例，年手术量2000余例。
学科亚专业包括器官移植、泌尿系肿瘤、泌尿系统疾病微创治疗、泌尿系结石、功能泌尿外科(盆底及排尿功能障碍和下尿路疾病)、男科学、前列腺疾病等。近年在亲属肾移植、泌尿系统肿瘤微创治疗、泌尿系统结石微创治疗等方面，取得飞速发展，在国内有很大影响。获得肾移植专业资质单位，目前科内还设有盆底疾病治疗中心，前列腺增生健康基地等机构。
北京朝阳医院泌尿外科是首都医科大学泌尿学系主任单位之一，承担首都医科大学博士生、硕士生培养任务及本科生的教学工作，同时承担博士后流动站工作。现已培养博士、硕士30余名，博士后2名。北京朝阳医院泌尿外科是北京市泌尿外科重要的教学基地之一，是我国泌尿外科专科医师培训基地及北京市住院医师培训基地。
近年来北京朝阳医院泌尿外科在科研工作中颇有斩获，先后获得中华医学科技奖一等奖，北京市医学科技三等奖，华夏医学科技三等奖等奖励；获批国家专利4项；获得多项国家级及省部级科研基金，资助金额达数千万元，其中包括国家“十五”攻关子课题、国家自然科学基金及省部级各项基金；2001年以来共发表学术论文500余篇，其中SCI收录100余篇。
泌尿外科还成功举办三届国际器官移植研讨会，五届全国肾移植学习班，十届全国泌尿外科微创学习班以及每年一次的北京血液净化学术论坛。每年泌尿外科有10余人次参加国际学术会议，担任大会发言或主持会议，在泌尿学术界享有较高声誉。设在泌尿外科的《国际移植与血液净化杂志》已成为肾移植与血液净化专业新的学术平台。
科室特色
1.以腹腔镜手术为代表的微创手术治疗。具有创伤小、无切口或小切口、手术时间短、出血少、恢复快、住院时间短等优点，极大减少了患者的病痛，提高了生活质量。泌尿外科已行数千例腹腔镜手术，常规开展的腹腔镜肾囊肿去顶术、腹腔镜肾上腺腺瘤切除术、腹腔镜输尿管切开取石术、腹腔镜肾盂成形术、腹腔镜肾癌根治术、腹腔镜肾部分切除术之外。
目前处于全国比较领先水平的特色手术包括：腹腔镜根治性膀胱切除术加尿流改道术治疗膀胱癌，其中T型原位回肠膀胱，原位回肠膀胱术至今已经完成数百例，是国内完成较多的单位之一，极大提高了膀胱癌治愈率和患者生活质量；结合术中超声行保留正常肾组织的肾部分切除术治疗肾癌，做到切除完全，降低复发率，提高生存率，保留肾功能的治疗效果；腹腔镜根治性前列腺切除术治疗前列腺癌，并发症少。
近期成功开展了国内全腹腔镜肾癌根治加腔静脉取瘤栓术、腹腔镜巨大嗜铬细胞瘤切除术以及单孔腹腔镜腔静脉后输尿管狭窄段切除再吻合术。
2.肾移植。肾移植学科创建于上个世纪90年代初，是泌尿外科的传统优势专业，拥有较先进的HLA配型室、临床药检室、动物实验室、肾脏病研究室和血液净化中心。在肾移植、胰肾联合移植、胰岛细胞移植及亲属肾移植、血液净化、重建血液透析通路等方面始终位居全国较领先水平。
肾移植团队全面开展移植相关实验室评估、器官获取、移植手术、围手术期支持、术后随访工作。目前肾移植总数已超过3000例，是国内肾移植数量较多的单位，在北京及全国移植领域享有很高的声誉。近年在腹腔镜活体供肾的切取手术、再次移植、致敏患者移植、免疫耐受诱导、受者长期存活等方面取得很大的成绩，并为同行认可。完成4例DCD(心脏死亡后捐献)器官的捐献工作，为10余位器官衰竭的患者提供了器官来源，这也是我国今后解决肾移植器官来源短缺的发展方向。
3.血液净化。是目前国内较大规模的血液净化中心，拥有较先进的透析机、反渗净化水生成装置制备；开展血液透析、血液滤过、血液透析滤过、高通量血液透析、可调钠透析、序贯透析、无肝素透析、体外肝素化透析、血液灌流、蛋白A免疫吸附及连续不卧床腹膜透析等较先进的血液净化方法。
血液净化中心在重危病人、围手术期病人的治疗方面积累了丰富的经验。中心已为广大的肾功能衰竭患者、肾移植围手术期的患者、胰-肾联合移植患者及肝-肾联合移植患者进行了成功的血液净化治疗。
4.肾与膀胱肿瘤的规范化治疗。对膀胱癌患者实行个性化治疗，早期膀胱癌行经尿道电切术，术后行膀胱腔内灌注化疗，定期行膀胱镜等检查；对浸润性膀胱癌患者，实施膀胱癌根治性切除及各种尿流改道手术数百例，膀胱切除后原位新膀胱重建是泌尿外科的特色手术。
尤其是腹腔镜技术大大减少了患者的创伤，极大地提高了患者的生活质量，得到广大患者的好评。对浸润性膀胱癌实施术前新辅助化疗和术后辅助性化疗，采用吉西他滨与顺铂联合化疗方案，明显提高了手术疗效和膀胱癌患者的生存率。
对肾癌患者实施标准的腹腔镜肾癌根治术，选择具有适应症的患者行保留肾单位的肾癌根治术，尤其是高选择性肾部分切除术，既达到治疗肿瘤的目的，又最大限度地保留了肾功能。泌尿外科已完成腹腔镜肾部分切除术300余例，具有丰富的经验，创伤小，并发症少，恢复快。成功实施多例肾癌伴肾静脉及腔静脉瘤栓手术，完成了全腹腔镜肾癌根治加腔静脉取瘤栓术。对可能有转移或已经发生转移的患者进行靶向治疗与免疫治疗，取得良好的疗效。
5.早期规范诊断前列腺癌。对有穿刺指征的患者进行超声引导下前列腺穿刺活检，采用五区十三针的穿刺方法，提高了前列腺癌早期诊断率；对诊断为早期前列腺癌的患者实施腹腔镜前列腺癌根治性切除术，在保留性神经方面有丰富经验，在保证治疗效果的前提下改善生活质量。泌尿外科已施行前列腺癌根治术数百例，给前列腺癌患者带来了福音。对晚期前列腺癌进行规范的雄激素阻断治疗及放化疗，积累了大量的病例资料及治疗经验。
6.泌尿系碎石术。泌尿外科开展经皮肾镜碎石术、输尿管镜碎石术，拥有较先进的第四代气压弹道联合超声碎石机，已施行输尿管镜及经皮肾镜碎石数千例，积累了大量的碎石取石经验，出血少，残石率低并发症少等优势，开展输尿管软镜激光碎石，进一步减少创伤，提高治疗效果。
7.良性前列腺增生治疗。良性前列腺增生症是老年常见疾病，泌尿外科已行数千例前列腺增生微创手术，包括经尿道前列腺电切术、等离子电切术、激光汽化术，可以最大程度的减少患者创伤，出血少，疗效好。对于大体积前列腺，泌尿外科采用保留尿道的腹腔镜前列腺增生部摘除术，解除患者排尿梗阻，减少患者术后不适，达到了国际较先进水平。
8.上尿路梗阻。上尿路梗阻是导致肾积水、肾功能不全的重要原因，泌尿外科采用包括开放手术、腹腔镜手术、肾造瘘、输尿管狭窄段激光内切开、球囊扩张和金属输尿管支架等在内的综合方法，治疗由各种原因引起的输尿管狭窄与肾积水，是泌尿外科的治疗特色之一。在晚期肿瘤导致的上尿路积水治疗方面，我们所应用的包括肾造瘘、肾盂膀胱转流、输尿管支架早期植入、尿流改道等治疗措施，积累了大量的经验，使患者获得更好的生活质量。
9.排尿功能障碍。本专业人员配备齐全，设备配置较先进，硬件配置达到较高水平。目前在神经原性膀胱、膀胱出口梗阻、间质性膀胱、尿失禁、前列腺疾病、盆底脱垂、功能性排尿障碍、各种术后排尿障碍等多种下尿路尿控领域中取得了突出的成绩，为下尿路疾患排忧解难，取得了良好的经济、社会效益。近年侧重于顽固性下尿路疾病的诊治和研究，在经闭孔吊带治疗女性压力性尿失禁、间质性膀胱炎的诊治、骶神经电刺激治疗顽固性下尿路症状方面取得飞速进展。
10.男科学是我们的又一特色亚专业。专业治疗常见病前列腺炎等常见病，开展阴茎假体植入治疗勃起功能障碍；显微镜下输尿管吻合术、精索静脉结扎术治疗不育等；睾丸活检、取精与生殖医学科合作进行不育治疗等方面均已达到国内较先进水平。