2006年成立输血科，前身为1958年建院时的血库。现有工作人员11名，医师系列4人、技师系列7人；其中高级职称3名，研究生学历8人。是“北京市临床输血质量改进和控制中心”副主任委员单位和北京市“朝阳区临床输血质量改进和控制中心”主任委员单位；卫生部临床输血相容性检测室间质评五家网络实验室之一。作为“北京市临床输血技术人员培训基地”，承担着本院、北京市及外埠各医疗机构临床输血人员的培训教学工作，截止2022年共培训各类人员近150余人。

科室秉承“胸怀博爱、严谨务实、慎思探索、真诚服务”的科训和“团结协作、纪律严明、创新进取、无私奉献”的科风，全心全意为临床、为患者服务；主要负责全院患者围术期、内科治疗以及放射治疗安全输血检测与管理。科室具备较为完善的临床输血质量管理文件，初步建立了临床用血质量管理体系，为临床安全输血提供了有效的保障。年度临床用血量达2万余单位，年疑难输血检测300余人次；自2003年参加北京市、卫生部临床输血相容性检测室间质评，成绩均优秀。2011年12月通过北京市卫生局 “增设输血科诊疗科目”注册验收，同年在我院输血科的倡导下创建了北京市“北京临床输血青年沙龙”，每季度一期进行输血学术交流活动，促进青年人才的培养和成长，为输血行业的发展注入新鲜的血液和活力。

近年来，科室承担或主要参与国家自然科学基金、卫生行业专项、医科院创新工程等课题13项，主要参与国家及行业标准制定8项，牵头起草国内专家共识2项，主编书籍1部，参编书籍5部，在国内外期刊发表论文近50篇。

诊疗范围：输血免疫血清学相关检测工作包括ABO及RhD血型鉴定、不规则抗体筛查、抗体鉴定、Rh分型检测、直接和间接Coomb’s试验、疑难配血、血小板抗体检测等；临床输血方面包括输血评估与疗效评价、自体血采集、输血不良反应调查与确认、临床输血病例会诊等。